RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	TM4SF20	Q53R12	229 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CLK1-208	ENST00000464454	CD276	Q5ZPR3	534 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CLK1-208	ENST00000464454	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
CLK1-208	ENST00000464454	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CLK1-208	ENST00000464454	KIF18B	Q86Y91	864 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CLK1-208	ENST00000464454	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
CLK1-208	ENST00000464454	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
CLK1-208	ENST00000464454	NOX5	Q96PH1	765 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CLK1-208	ENST00000464454	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CLK1-208	ENST00000464454	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CLK1-208	ENST00000464454	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	ACOT7	O00154	380 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	CBX4	O00257	560 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	SCD	O00767	359 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	IRF9	Q00978	393 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	ADAM9	Q13443	819 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	PTPRO	Q16827	1216 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	SP8	Q8IXZ3	490 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF839	A8K0R7	811 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454		H7C1D1	291 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	KCNK3	O14649	394 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	FFAR3	O14843	346 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	GAS7	O60861	476 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	CPZ	Q66K79	652 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	LIPI	Q6XZB0	460 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	PROSER1	Q86XN7	944 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	DTX3	Q8N9I9	347 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	TRAF5	O00463	557 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	KPNA6	O60684	536 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	CHGB	P05060	677 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	SDHA	P31040	664 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	PFKP	Q01813	784 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF174	Q15697	407 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	STK32C	Q86UX6	486 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	CARF	Q8N187	725 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	DLG3	Q92796	817 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454		A0A087X0B3	334 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	FOXP2	O15409	715 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	PDE8A	O60658	829 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	KRT37	O76014	449 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	FBXO21	O94952	628 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	PTGS1	P23219	599 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	AOAH	P28039	575 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	FBLN7	Q53RD9	439 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	SYT3	Q9BQG1	590 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	ACSS2	Q9NR19	701 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	CROT	Q9UKG9	612 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	ASB1	Q9Y576	335 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	SASH1	O94885	1247 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	F2	P00734	622 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	FNTB	P49356	437 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	KIF11	P52732	1056 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	OCRL	Q01968	901 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	PRR31	Q5SQ13	230 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CLK1-208	ENST00000464454	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		5.79	□□□□□ -1.48

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