RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460258.5

NOP56-204, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 4

Gene NOP56, Length 837 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-204ENST00000460258 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
NOP56-204ENST00000460258 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.78□□□□□ -0.04
NOP56-204ENST00000460258 FBXO4Q9UKT5 387 aa14.78□□□□□ -0.04
NOP56-204ENST00000460258 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NOP56-204ENST00000460258 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.78□□□□□ -0.04
NOP56-204ENST00000460258 CYSRT1A8MQ03 144 aa14.77□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 TBC1D4O60343 1298 aa14.77□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 GNAI2P04899 355 aa14.77□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 KANK3Q6NY19 840 aa14.77□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 RASGRP2Q7LDG7 609 aa14.77□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.77□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 ZBTB44Q8NCP5 570 aa14.77□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.77□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 AKAP13Q12802 2813 aa14.76□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 PATJQ8NI35 1801 aa14.76□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 GOLIM4O00461 696 aa14.76□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 LAMTOR5O43504 91 aa14.76□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 LILRB5O75023 590 aa14.76□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 PRDM1O75626 825 aa14.76□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 STAG3L1P0CL83 205 aa14.76□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 ZSCAN32Q9NX65 697 aa14.76□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 LZTS1Q9Y250 596 aa14.76□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa14.76□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.75□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 H3BRB1 525 aa14.75□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 SORBS3O60504 671 aa14.75□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 LRRN2O75325 713 aa14.75□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.75□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 SBK1Q52WX2 424 aa14.75□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 PJA1Q8NG27 643 aa14.75□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 GPR20Q99678 358 aa14.75□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 FOXQ1Q9C009 403 aa14.75□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 SETD4Q9NVD3 440 aa14.75□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.75□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 GDF9O60383 454 aa14.74□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 GNAT1P11488 350 aa14.74□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 ADD2P35612 726 aa14.74□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 POLA2Q14181 598 aa14.74□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 STXBP2Q15833 593 aa14.74□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 IL31Q6EBC2 164 aa14.74□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 CCDC149Q6ZUS6 474 aa14.74□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa14.74□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 RSAD2Q8WXG1 361 aa14.74□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 SPATA33Q96N06 139 aa14.74□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.74□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 DACH1Q9UI36 760 aa14.74□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 KAT6AQ92794 2004 aa14.73□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 SLC16A2P36021 539 aa14.73□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 MGAT3Q09327 533 aa14.73□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 FBXO47Q5MNV8 452 aa14.73□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.73□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.73□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 FEZF2Q8TBJ5 459 aa14.73□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 GPR152Q8TDT2 470 aa14.73□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 HCSTQ9UBK5 93 aa14.73□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 LRFN2Q9ULH4 789 aa14.73□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.73□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 TMEM8BA6NDV4 472 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 LRP3O75074 770 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 TSPY3P0CV98 308 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 TSPY8P0CW00 308 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 SRFP11831 508 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 SCG2P13521 617 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 ATP8B2P98198 1209 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 PLCB3Q01970 1234 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 LPAL2Q16609 132 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 TMC7Q7Z402 723 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 DZANK1Q9NVP4 752 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 MTMR7Q9Y216 660 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 LAMA5O15230 3695 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 CHGBP05060 677 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 CD52P31358 61 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 ARHGAP4P98171 946 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 CCDC96Q2M329 555 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-204ENST00000460258 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms