RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440016.6

HOXD-AS2-202, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 999 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa30.67■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KIF28PB7ZC32 967 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 WNT7AO00755 349 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PTK7Q13308 1070 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SWSAP1Q6NVH7 229 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATP6V0A1Q93050 837 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SAMM50Q9Y512 469 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NRCAMQ92823 1304 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A0A1W2PPC1 479 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 WDR64B1ANS9 1081 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PITPNM1O00562 1244 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TREHO43280 583 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CHMP2AO43633 222 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PSAPP07602 524 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GNAT1P11488 350 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CSF2RAP15509 400 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EPHB4P54760 987 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PPFIA1Q13136 1202 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BFSP2Q13515 415 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PLCB4Q15147 1175 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCDC155Q8N6L0 562 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CAGE1Q8TC20 777 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LMBR1Q8WVP7 490 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM20AQ96MK3 541 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DISC1Q9NRI5 854 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SCN5AQ14524 2016 aa30.64■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TBX3O15119 743 aa30.64■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC26A2P50443 739 aa30.64■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ADAM17P78536 824 aa30.64■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP30.64■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 B3GNT9Q6UX72 402 aa30.64■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SERINC5Q86VE9 423 aa30.64■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NOSTRINQ8IVI9 506 aa30.64■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TDHQ8IZJ6 230 aa30.64■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HAS1Q92839 578 aa30.64■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 WNT8BQ93098 351 aa30.64■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SCLYQ96I15 445 aa30.64■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRPC6Q9Y210 931 aa30.64■■■□□ 2.5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SFNP31947 248 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 JAK3P52333 1124 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GRIK4Q16099 956 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PDXDC2PQ6P474 469 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RETREG2Q8NC44 543 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa30.62■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 INSRRP14616 1297 aa30.62■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP30.62■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RBL2Q08999 1139 aa30.62■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SNX21Q969T3 373 aa30.62■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GABBR1Q9UBS5 961 aa30.62■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 POTEB3A0JP26 581 aa30.61■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MARCH6O60337 910 aa30.61■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATP2B1P20020 1258 aa30.61■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 POTEBQ6S5H4 581 aa30.61■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MIER3Q7Z3K6 550 aa30.61■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RDM1Q8NG50 284 aa30.61■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 VAV3Q9UKW4 847 aa30.61■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa30.61■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 H3BQV1 296 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IQCF3P0C7M6 154 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CKBP12277 381 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATP4AP20648 1035 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C9orf50Q5SZB4 431 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATP8B4Q8TF62 1192 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IL23AQ9NPF7 189 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NEMFO60524 1076 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BAG4O95429 457 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ACRP10323 421 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IGBP1P78318 339 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PPP2R5CQ13362 524 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SHHQ15465 462 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MARCH8Q5T0T0 291 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C16orf59Q7L2K0 433 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLFN12Q8IYM2 578 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RRN3P2A6NIE6 340 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HBP1O60381 514 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SELPP16109 830 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CALCRLQ16602 461 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MCTP1Q6DN14 999 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LRRC8DQ7L1W4 858 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP30.58■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TUBE1Q9UJT0 475 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC34A2O95436 690 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MCM7P33993 719 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UGCGQ16739 394 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF618Q5T7W0 954 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CKAP2LQ8IYA6 745 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXD-AS2-202ENST00000440016 VWCEQ96DN2 955 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXD-AS2-202ENST00000440016 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EML1O00423 815 aa30.56■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms