RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 USP38Q8NB14 1042 aa15.76■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 CCDC148Q8NFR7 591 aa15.76■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 DBF4BQ8NFT6 615 aa15.76■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa15.76■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 ERAP1Q9NZ08 941 aa15.76■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa15.76■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 NRCAMQ92823 1304 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 LCHNA4D1U4 455 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 EDIL3O43854 480 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 LGR5O75473 907 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 GNA11P29992 359 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 SCRN1Q12765 414 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 ADGRE1Q14246 886 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.113e-7■□□□□ 10.5
PRAME-209ENST00000439106 PPM1EQ8WY54 764 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 TUBE1Q9UJT0 475 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 TPCN1Q9ULQ1 816 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 TRPC6Q9Y210 931 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 A0A0C4DFX4 3053 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 KIAA1671Q9BY89 1806 aa15.75■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 EPOPA6NHQ4 379 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 RFXAPO00287 272 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 DHX15O43143 795 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 PARNO95453 639 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 CYP3A4P08684 503 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 GNAT1P11488 350 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 INSRRP14616 1297 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 NLRP5P59047 1200 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 PLCB4Q15147 1175 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 PRR16Q569H4 304 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 MARCH8Q5T0T0 291 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 NIPA1Q7RTP0 329 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 TEX2Q8IWB9 1127 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 TRIM22Q8IYM9 498 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 AZI2Q9H6S1 392 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 BRWD1Q9NSI6 2320 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 TLL1O43897 1013 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 DEXIO95424 95 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 LARGE1O95461 756 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 IGFBP4P22692 258 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 STAT5BP51692 787 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 AK2P54819 239 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP15.73■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 DNAJB3Q8WWF6 145 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 GJA10Q969M2 543 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 ZNF577Q9BSK1 485 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 PRDM6Q9NQX0 595 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 KCNJ14Q9UNX9 436 aa15.73■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 VCANP13611 3396 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 TTC3P53804 2025 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 BACH1O14867 736 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 CHRNA1P02708 482 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 GHRP10912 638 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 TAP1Q03518 808 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 IKBKEQ14164 716 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 NPY5RQ15761 445 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 MYOCDQ8IZQ8 938 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 BICD2Q8TD16 824 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 LENG9Q96B70 501 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 ZBED2Q9BTP6 218 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 SH3GLB2Q9NR46 395 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 GJB4Q9NTQ9 266 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 PCDHA4Q9UN74 947 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 ATG7O95352 703 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 CTDNEP1O95476 244 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 SETQ01105 290 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 MGAT3Q09327 533 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 TMEM62Q0P6H9 643 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 ABHD15Q6UXT9 468 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 MICALL1Q8N3F8 863 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 NECAB1Q8N987 351 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 TBCKQ8TEA7 893 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 ARNTL2Q8WYA1 636 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-209ENST00000439106 MYO7AQ13402 2215 aa15.71■□□□□ 0.1
PRAME-209ENST00000439106 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa15.7■□□□□ 0.1
PRAME-209ENST00000439106 POTEB3A0JP26 581 aa15.7■□□□□ 0.1
PRAME-209ENST00000439106 KIF28PB7ZC32 967 aa15.7■□□□□ 0.1
PRAME-209ENST00000439106 MSH4O15457 936 aa15.7■□□□□ 0.1
PRAME-209ENST00000439106 PFKFB2O60825 505 aa15.7■□□□□ 0.1
PRAME-209ENST00000439106 CAND2O75155 1236 aa15.7■□□□□ 0.1
PRAME-209ENST00000439106 GJB5O95377 273 aa15.7■□□□□ 0.1
PRAME-209ENST00000439106 TDP2O95551 362 aa15.7■□□□□ 0.1
PRAME-209ENST00000439106 ATP4AP20648 1035 aa15.7■□□□□ 0.1
PRAME-209ENST00000439106 CIITAP33076 1130 aa15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms