RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409911.5

LRRTM4-205, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,976 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-205ENST00000409911 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ZFPM2Q8WW38 1151 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 OSBP2Q969R2 916 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 FNBP1Q96RU3 617 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 CARD9Q9H257 536 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 VCXQ9H320 206 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 TPK1Q9H3S4 243 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 DISC1Q9NRI5 854 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 LAMA4Q16363 1823 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SPTLC1O15269 473 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 CYP21A2P08686 494 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 PIK3CAP42336 1068 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 MCAMP43121 646 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 PEX5P50542 639 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 VSNL1P62760 191 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 RNF220Q5VTB9 566 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 TBC1D9BQ66K14 1250 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 C6orf89Q6UWU4 347 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 RELL1Q8IUW5 271 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 NECAB1Q8N987 351 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SKA1Q96BD8 255 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SCYL1Q96KG9 808 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 TCF12Q99081 682 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SYT15Q9BQS2 421 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 HPCAL4Q9UM19 191 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 BCORQ6W2J9 1755 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SP100P23497 879 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 GSTT1P30711 240 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SKOR1P84550 965 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 STIM1Q13586 685 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ME3Q16798 604 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 METTL24Q5JXM2 366 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 TMTC4Q5T4D3 741 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ANO7Q6IWH7 933 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 FAM173BQ6P4H8 233 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 CCDC83Q8IWF9 413 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SCAIQ8N9R8 606 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 C1orf74Q96LT6 269 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SQORQ9Y6N5 450 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 MAST3O60307 1309 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 LRP5O75197 1615 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SBF2Q86WG5 1849 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 DNM1LO00429 736 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 KCNJ13O60928 360 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 LCA5LO95447 670 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 PORP16435 677 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 GJB2P29033 226 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 PHKA1P46020 1223 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SCTRP47872 440 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 NLRP9Q7RTR0 991 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 CERKQ8TCT0 537 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 IFT81Q8WYA0 676 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 UQCC2Q9BRT2 126 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 LRRC2Q9BYS8 371 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 GLT8D2Q9H1C3 349 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 CNNM1Q9NRU3 951 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 DACT1Q9NYF0 836 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 EURLQ9NYK6 297 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SATB2Q9UPW6 733 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 CCDC162PA2VCL2 907 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 H0Y3Z8 333 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SNX2O60749 519 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 GGCXP38435 758 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ETV3P41162 512 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 TUBA4AP68366 448 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ERFEQ4G0M1 354 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 WDR45BQ5MNZ6 344 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 TMEM154Q6P9G4 183 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 TAOK1Q7L7X3 1001 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 AGAP11Q8TF27 550 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms