RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 HOXC8P31273 242 aa23.46■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 TRAPPC10P48553 1259 aa23.46■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.46■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 FAM160B1Q5W0V3 765 aa23.46■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa23.46■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 RETREG2Q8NC44 543 aa23.46■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 KAT6AQ92794 2004 aa23.46■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 SLC5A5Q92911 643 aa23.46■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
C4orf48-201ENST00000409248 UMODL1Q5DID0 1318 aa23.45■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 NRCAMQ92823 1304 aa23.45■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 BACH1O14867 736 aa23.45■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 ATG7O95352 703 aa23.45■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 MARK3P27448 753 aa23.45■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 SLC26A2P50443 739 aa23.45■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 RESTQ13127 1097 aa23.45■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 PTK7Q13308 1070 aa23.45■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.45■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.45■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.45■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 UIMC1Q96RL1 719 aa23.45■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.45■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 WDR64B1ANS9 1081 aa23.44■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 CSF2RAP15509 400 aa23.44■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 STAT5BP51692 787 aa23.44■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 PPFIA1Q13136 1202 aa23.44■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 PKP1Q13835 747 aa23.44■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 ABHD15Q6UXT9 468 aa23.44■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.44■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 CTAGE1Q96RT6 745 aa23.44■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 PCYT2Q99447 389 aa23.44■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 WNT8AQ9H1J5 351 aa23.44■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 BRD1O95696 1058 aa23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 F13A1P00488 732 aa23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 PSAPP07602 524 aa23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 ATP2B1P20020 1258 aa23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 DDIT3P35638 169 aa23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 CCL23P55773 120 aa23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 NUCB2P80303 420 aa23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 RBL2Q08999 1139 aa23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 SERINC5Q86VE9 423 aa23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 ETNPPLQ8TBG4 499 aa23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 RNPEPQ9H4A4 650 aa23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 TRPC6Q9Y210 931 aa23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 SAMM50Q9Y512 469 aa23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 SLC37A4O43826 429 aa23.42■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 SFNP31947 248 aa23.42■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 RFC2P35250 354 aa23.42■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 JAK3P52333 1124 aa23.42■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 TTC38Q5R3I4 469 aa23.42■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 FAM20AQ96MK3 541 aa23.42■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 IL23AQ9NPF7 189 aa23.42■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF302Q9NR11 478 aa23.42■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 SETD4Q9NVD3 440 aa23.42■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 TBX3O15119 743 aa23.41■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 PSMD10O75832 226 aa23.41■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 PFKMP08237 780 aa23.41■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 GRIK4Q16099 956 aa23.41■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 PDXDC2PQ6P474 469 aa23.41■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 RDM1Q8NG50 284 aa23.41■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 WDR81Q562E7 1941 aa23.4■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 RRN3P2A6NIE6 340 aa23.4■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 CHMP2AO43633 222 aa23.4■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 MARCH6O60337 910 aa23.4■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 CAND2O75155 1236 aa23.4■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 SELPP16109 830 aa23.4■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 EPHB4P54760 987 aa23.4■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 HIC1Q14526 733 aa23.4■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 LRRC8DQ7L1W4 858 aa23.4■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 SCLYQ96I15 445 aa23.4■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.4■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 DISC1Q9NRI5 854 aa23.4■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.4■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa23.39■■□□□ 1.34
C4orf48-201ENST00000409248 POTEB3A0JP26 581 aa23.39■■□□□ 1.33
C4orf48-201ENST00000409248 TREHO43280 583 aa23.39■■□□□ 1.33
C4orf48-201ENST00000409248 IQCF3P0C7M6 154 aa23.39■■□□□ 1.33
C4orf48-201ENST00000409248 CKBP12277 381 aa23.39■■□□□ 1.33
C4orf48-201ENST00000409248 PLCB4Q15147 1175 aa23.39■■□□□ 1.33
C4orf48-201ENST00000409248 SHHQ15465 462 aa23.39■■□□□ 1.33
C4orf48-201ENST00000409248 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms