RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 PRDM12Q9H4Q4 367 aa30.84■■■□□ 2.53
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GNPTAB-202ENST00000392919 ACTN1P12814 892 aa30.83■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 TRAF7Q6Q0C0 670 aa30.83■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 TRIM50Q86XT4 487 aa30.83■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa30.83■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa30.82■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 NBNO60934 754 aa30.82■■■□□ 2.52
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GNPTAB-202ENST00000392919 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa30.82■■■□□ 2.52
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GNPTAB-202ENST00000392919 PKD2L1Q9P0L9 805 aa30.82■■■□□ 2.52
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GNPTAB-202ENST00000392919 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa30.81■■■□□ 2.52
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GNPTAB-202ENST00000392919 SMC3Q9UQE7 1217 aa30.81■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa30.81■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM205CA6NFA0 338 aa30.8■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 DLL1O00548 723 aa30.8■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 LENG9Q96B70 501 aa30.8■■■□□ 2.52
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GNPTAB-202ENST00000392919 C17orf102A2RUQ5 167 aa30.79■■■□□ 2.52
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GNPTAB-202ENST00000392919 MBTPS1Q14703 1052 aa30.79■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 PRR16Q569H4 304 aa30.79■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 SERINC5Q86VE9 423 aa30.79■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 KIF3AQ9Y496 699 aa30.79■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 MYO9BQ13459 2157 aa30.79■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 CHD9Q3L8U1 2897 aa30.79■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 PTPRSQ13332 1948 aa30.79■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 EYSQ5T1H1 3165 aa30.78■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa30.78■■■□□ 2.52
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GNPTAB-202ENST00000392919 CXCL10P02778 98 aa30.78■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 CYP3A7P24462 503 aa30.78■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 SETQ01105 290 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP30.78■■■□□ 2.52
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GNPTAB-202ENST00000392919 ATP6V0A1Q93050 837 aa30.78■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 MBOAT7Q96N66 472 aa30.78■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC9A7Q96T83 725 aa30.78■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 NFASCO94856 1347 aa30.77■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 TREHO43280 583 aa30.77■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 ADGRE1Q14246 886 aa30.77■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 PPP2R2DQ66LE6 453 aa30.77■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 MOXD1Q6UVY6 613 aa30.77■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 SETD4Q9NVD3 440 aa30.77■■■□□ 2.52
GNPTAB-202ENST00000392919 LETM2Q2VYF4 491 aa30.76■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
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GNPTAB-202ENST00000392919 UIMC1Q96RL1 719 aa30.76■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa30.75■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 BAIAP3O94812 1187 aa30.75■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 CA3P07451 260 aa30.75■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 THPOP40225 353 aa30.75■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 Q4G0T1 1027 aa30.75■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 HERC6Q8IVU3 1022 aa30.75■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa30.75■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 DHX15O43143 795 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGEF15O94989 841 aa30.74■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 PARNO95453 639 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 WDR5P61964 334 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 CNKSR3Q6P9H4 555 aa30.74■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 HSCBQ8IWL3 235 aa30.74■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 SDF4Q9BRK5 362 aa30.74■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF577Q9BSK1 485 aa30.74■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 UNC80Q8N2C7 3258 aa30.73■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 MSH4O15457 936 aa30.73■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 DEFB103AP81534 67 aa30.73■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 KIF28PB7ZC32 967 aa30.72■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 KCNJ6P48051 423 aa30.72■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 PPP4R3AQ6IN85 833 aa30.72■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 PPM1EQ8WY54 764 aa30.72■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 OSBPL7Q9BZF2 842 aa30.72■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC9A2Q9UBY0 812 aa30.72■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 RSPH10B2B2RC85 870 aa30.71■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC37A4O43826 429 aa30.71■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 RSPH10BP0C881 870 aa30.71■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 ADAM17P78536 824 aa30.71■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 LMBR1Q8WVP7 490 aa30.71■■■□□ 2.51
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