RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 NEBLO76041 1014 aa22.12■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 PAX7P23759 505 aa22.12■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 METTL13Q8N6R0 699 aa22.12■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC12A4Q9UP95 1085 aa22.12■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
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PPP1CC-201ENST00000335007 ASAP2O43150 1006 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 MECOMQ03112 1051 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 RASGEF1CQ8N431 466 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC63Q8NA47 563 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 CCHCR1Q8TD31 782 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 AMACRQ9UHK6 382 aa22.11■■□□□ 1.13
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PPP1CC-201ENST00000335007 SMCO2A6NFE2 343 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
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PPP1CC-201ENST00000335007 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 TBCKQ8TEA7 893 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 RAB34Q9BZG1 259 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 GANQ9H2C0 597 aa22.11■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 RTN2O75298 545 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 EPS15P42566 896 aa22.1■■□□□ 1.13
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PPP1CC-201ENST00000335007 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 EBF2Q9HAK2 575 aa22.1■■□□□ 1.13
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PPP1CC-201ENST00000335007 CFAP73A6NFT4 308 aa22.1■■□□□ 1.13
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PPP1CC-201ENST00000335007 RPSAP08865 295 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 SOGA3Q5TF21 947 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 MTMR9Q96QG7 549 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.1■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 TTI1O43156 1089 aa22.09■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 COASYQ13057 564 aa22.09■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 SEPT2Q15019 361 aa22.09■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 PPP2R5AQ15172 486 aa22.09■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 MDM1Q8TC05 714 aa22.09■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.09■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 BATF3Q9NR55 127 aa22.09■■□□□ 1.13
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PPP1CC-201ENST00000335007 PNMA2Q9UL42 364 aa22.09■■□□□ 1.13
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PPP1CC-201ENST00000335007 RAB17Q9H0T7 212 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PPP1CC-201ENST00000335007 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.08■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 ITGA4P13612 1032 aa22.08■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 KRT79Q5XKE5 535 aa22.08■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.08■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.08■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 SAMD15Q9P1V8 674 aa22.08■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 MTMR7Q9Y216 660 aa22.08■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 COL4A1P02462 1669 aa22.08■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 CHN1P15882 459 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 CALRP27797 417 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 PIGWQ7Z7B1 504 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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PPP1CC-201ENST00000335007 DPH5Q9H2P9 285 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.07■■□□□ 1.12
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PPP1CC-201ENST00000335007 ACCSLQ4AC99 568 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 NAGPAQ9UK23 515 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 USP17L8P0C7I0 530 aa22.06■■□□□ 1.12
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PPP1CC-201ENST00000335007 TSPY8P0CW00 308 aa22.06■■□□□ 1.12
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PPP1CC-201ENST00000335007 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 SLFN11Q7Z7L1 901 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 TCP11Q8WWU5 503 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PPP1CC-201ENST00000335007 FLOT1O75955 427 aa22.06■■□□□ 1.12
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