RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC102AQ96A19 550 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-201ENST00000311008 REEP2Q9BRK0 252 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-201ENST00000311008 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-201ENST00000311008 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-201ENST00000311008 TLR2O60603 784 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-201ENST00000311008 C10orf76Q5T2E6 689 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-201ENST00000311008 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-201ENST00000311008 SPATA4Q8NEY3 305 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-201ENST00000311008 COG1Q8WTW3 980 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-201ENST00000311008 UIMC1Q96RL1 719 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-201ENST00000311008 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-201ENST00000311008 VPS18Q9P253 973 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-201ENST00000311008 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-201ENST00000311008 VAV3Q9UKW4 847 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-201ENST00000311008 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-201ENST00000311008 EYA4O95677 639 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 GAP43P17677 238 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 PSMC6P62333 389 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 ASIC2Q16515 512 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 SFR1Q86XK3 245 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 GANQ9H2C0 597 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 TBCAO75347 108 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 C2orf54Q08AI8 447 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 KLHL30Q0D2K2 578 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 NAB2Q15742 525 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 DRC1Q96MC2 740 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 PRR12Q9ULL5 1215 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 SCN9AQ15858 1988 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 AFPP02771 609 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 STAT2P52630 851 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 SNAP25P60880 206 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 RAPGEF1Q13905 1077 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 CSRNP1Q96S65 589 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 CRACR2AQ9BSW2 395 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 TUFT1Q9NNX1 390 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 MEIS1O00470 390 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 APBA3O96018 575 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 ANXA13P27216 316 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 TLR10Q9BXR5 811 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 OLFML3Q9NRN5 406 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 OPLAHO14841 1288 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 MUTP22033 750 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 CASP5P51878 434 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 TBC1D5Q92609 795 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 SALL4Q9UJQ4 1053 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 FBXL5Q9UKA1 691 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 HPCAL4Q9UM19 191 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 BTNL10A8MVZ5 291 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 BHMT2Q9H2M3 363 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 GOPCQ9HD26 462 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 EPB41P11171 864 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 AOC3Q16853 763 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.033e-8■■■□□ 16.2
SPNS1-201ENST00000311008 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 SLC15A2Q16348 729 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 EXOC3L4Q17RC7 722 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1W2PRG0 241 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 BUB1O43683 1085 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 HOXD13P35453 343 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 MSL1Q68DK7 614 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 FAM133AQ8N9E0 248 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 SPAG5Q96R06 1193 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 SELENOOQ9BVL4 669 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 TMX2Q9Y320 296 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 ATP8B3O60423 1300 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 NR3C1P04150 777 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 MYBP10242 640 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 LMAN1P49257 510 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 JAG1P78504 1218 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 NFIL3Q16649 462 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 CHURC1Q8WUH1 139 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-201ENST00000311008 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.46■■□□□ 1.03
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