RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309909.9

FBXW8-201, Transcript of F-box and WD repeat domain containing 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXW8, Length 2,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW8-201ENST00000309909 CLIC2O15247 247 aa22.22■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 NDUFA10O95299 355 aa22.22■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 CYP27A1Q02318 531 aa22.22■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 KCNMA1Q12791 1236 aa22.22■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 ELF2Q15723 593 aa22.22■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa22.22■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.22■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 PICK1Q9NRD5 415 aa22.22■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 SLU7O95391 586 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 CASQ1P31415 396 aa22.21■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.21■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 GCNT3O95395 438 aa22.2■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 NR2F2P24468 414 aa22.2■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 ARHGAP25P42331 645 aa22.2■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 TKFCQ3LXA3 575 aa22.2■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.2■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 KLRG1Q96E93 195 aa22.2■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 EPC1Q9H2F5 836 aa22.2■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 SAMM50Q9Y512 469 aa22.2■■□□□ 1.15
FBXW8-201ENST00000309909 SORBS3O60504 671 aa22.2■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 ZNF569Q5MCW4 686 aa22.2■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.2■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 MYCT1Q8N699 235 aa22.2■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 ANKRD7Q92527 254 aa22.2■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 RMDN3Q96TC7 470 aa22.2■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.2■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 RCCD1A6NED2 376 aa22.19■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 CASP4P49662 377 aa22.19■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 PLS1Q14651 629 aa22.19■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 B3GNT9Q6UX72 402 aa22.19■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 CARD6Q9BX69 1037 aa22.19■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.19■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.19■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.19■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 RPTORQ8N122 1335 aa22.19■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 COG2Q14746 738 aa22.19■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.19■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 DCAF15Q66K64 600 aa22.19■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.19■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.19■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 HERVK_113P62684 666 aa22.18■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 ZBED6P86452 979 aa22.18■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 MTMR1Q13613 665 aa22.18■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 PGM5Q15124 567 aa22.18■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.18■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.18■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 RRAGAQ7L523 313 aa22.18■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.18■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.18■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 ZBED4O75132 1171 aa22.17■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 SLC35F6Q8N357 371 aa22.17■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 RNF146Q9NTX7 359 aa22.17■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22.17■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 LRRC53A6NM62 1247 aa22.17■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 ZNF263O14978 683 aa22.17■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 AKAP3O75969 853 aa22.17■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.17■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 MEA1Q16626 185 aa22.17■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.17■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 GPC2Q8N158 579 aa22.17■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.17■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 ASTN1O14525 1302 aa22.16■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 USP14P54578 494 aa22.16■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 UGCGQ16739 394 aa22.16■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.16■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.16■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.16■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 NOL4O94818 638 aa22.15■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 FAM13AO94988 1023 aa22.15■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 LMNB1P20700 586 aa22.15■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 EPHA7Q15375 998 aa22.15■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.15■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 FIZ1Q96SL8 496 aa22.15■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.15■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 NUP58Q9BVL2 599 aa22.15■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.15■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 ADM5C9JUS6 153 aa22.15■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 TGFB1I1O43294 461 aa22.15■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.15■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
FBXW8-201ENST00000309909 ERO1AQ96HE7 468 aa22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms