RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303927.3

CAVIN3-201, Transcript of caveolae associated protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAVIN3, Length 1,174 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3-201ENST00000303927 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.74■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.74■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 REV3LO60673 3130 aa22.73■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 BAIAP3O94812 1187 aa22.73■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.73■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.73■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 C7orf31Q8N865 590 aa22.73■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.73■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.73■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.73■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.73■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 TRANK1O15050 2925 aa22.73■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.72■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 H3BRB1 525 aa22.72■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 PRR16Q569H4 304 aa22.72■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.72■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.72■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 ASB2Q96Q27 587 aa22.72■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.72■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 TTC28Q96AY4 2481 aa22.71■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 PTPRSQ13332 1948 aa22.71■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 SELPP16109 830 aa22.71■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 KRT2P35908 639 aa22.71■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.71■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.71■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 CERS4Q9HA82 394 aa22.71■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.71■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.71■■□□□ 1.23
CAVIN3-201ENST00000303927 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 MMP1P03956 469 aa22.7■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 RBL2Q08999 1139 aa22.7■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.7■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 MYO9BQ13459 2157 aa22.7■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 TET1Q8NFU7 2136 aa22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 TNFRSF10AO00220 468 aa22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 RFXAPO00287 272 aa22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 CKBP12277 381 aa22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 KCNJ6P48051 423 aa22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 GPNMBQ14956 572 aa22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 INF2Q27J81 1249 aa22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 KRT40Q6A162 431 aa22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 EMSYQ7Z589 1322 aa22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 KIF28PB7ZC32 967 aa22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 EDIL3O43854 480 aa22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 ARHGEF15O94989 841 aa22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 CYP3A7P24462 503 aa22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 ACTR2P61160 394 aa22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 TAP1Q03518 808 aa22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 Q4G0T1 1027 aa22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 NEK8Q86SG6 692 aa22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 OXER1Q8TDS5 423 aa22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 LENG9Q96B70 501 aa22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 TMX3Q96JJ7 454 aa22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 C8orf76Q96K31 380 aa22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.68■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 EPOPA6NHQ4 379 aa22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 TLL1O43897 1013 aa22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 PTK7Q13308 1070 aa22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 TRIM50Q86XT4 487 aa22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 GLG1Q92896 1179 aa22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 AZI2Q9H6S1 392 aa22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 KIF3AQ9Y496 699 aa22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 WDR81Q562E7 1941 aa22.67■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 NBNO60934 754 aa22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 LGR5O75473 907 aa22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 ATG7O95352 703 aa22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 CXCL10P02778 98 aa22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CAVIN3-201ENST00000303927 FOSBP53539 338 aa22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms