RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246891.8

CSN1S1-201, Transcript of casein alpha s1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSN1S1, Length 985 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1-201ENST00000246891 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.73□□□□□ -1.33
CSN1S1-201ENST00000246891 ST5P78524 1137 aa6.72□□□□□ -1.33
CSN1S1-201ENST00000246891 GUCY1A3Q02108 690 aa6.72□□□□□ -1.33
CSN1S1-201ENST00000246891 FIGNQ5HY92 759 aa6.72□□□□□ -1.33
CSN1S1-201ENST00000246891 PHF19Q5T6S3 580 aa6.72□□□□□ -1.33
CSN1S1-201ENST00000246891 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.72□□□□□ -1.33
CSN1S1-201ENST00000246891 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.72□□□□□ -1.33
CSN1S1-201ENST00000246891 CD244Q9BZW8 370 aa6.72□□□□□ -1.33
CSN1S1-201ENST00000246891 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.72□□□□□ -1.33
CSN1S1-201ENST00000246891 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.72□□□□□ -1.33
CSN1S1-201ENST00000246891 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.72□□□□□ -1.33
CSN1S1-201ENST00000246891 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.72□□□□□ -1.33
CSN1S1-201ENST00000246891 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.72□□□□□ -1.33
CSN1S1-201ENST00000246891 ACOT7O00154 380 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 ARVCFO00192 962 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 CUTAO60888 179 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 FAM209AQ5JX71 171 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 DNERQ8NFT8 737 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 KATNBL1Q9H079 304 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 SCRIBQ14160 1630 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 GPR42O15529 346 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 TNFRSF1AP19438 455 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 CRY1Q16526 586 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 DEF6Q9H4E7 631 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 EFCAB14O75071 495 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 PDE6AP16499 860 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 POLD1P28340 1107 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 CSF2RBP32927 897 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 ICAM4Q14773 271 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 SOGA3Q5TF21 947 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 KLC2Q9H0B6 622 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 CD248Q9HCU0 757 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 PATE3B3GLJ2 98 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 MATN3O15232 486 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 IL18BPO95998 194 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 PYGMP11217 842 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 SELENOPP49908 381 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 HS1BP3Q53T59 392 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 LMF1Q96S06 567 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 FBXO10Q9UK96 956 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 CCDC66A2RUB6 948 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 MAN2B1O00754 1011 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 FAM153BP0C7A2 387 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 KRT15P19012 456 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 HERVK_113P62684 666 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 ZXDAP98168 799 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 SERINC3Q13530 473 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 OSTM1Q86WC4 334 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 EXOC2Q96KP1 924 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 UNC13AQ9UPW8 1703 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.66□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.66□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.66□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 ZNF623O75123 536 aa6.66□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 CRTAMO95727 393 aa6.66□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 AMY2AP04746 511 aa6.66□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 AMY2BP19961 511 aa6.66□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 PTGS1P23219 599 aa6.66□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 RBL2Q08999 1139 aa6.66□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 RASA3Q14644 834 aa6.66□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.66□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.66□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 WDR48Q8TAF3 677 aa6.66□□□□□ -1.34
CSN1S1-201ENST00000246891 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms