RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000132397.1

Gm20517-202, Transcript of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20517, Length 4,807 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Arhgef16Q3U5C8 713 aa18.26■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rc3h1Q4VGL6 1130 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Atxn2lQ7TQH0 1049 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nacc1Q7TSZ8 514 aa18.26■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ptrh1Q8BW00 204 aa18.26■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ssx2ipQ8VC66 615 aa18.26■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sema3fO88632 785 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ahcyl2Q68FL4 613 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ppfia4B8QI36 1187 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfp94E9Q6Y4 486 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gjb6P70689 261 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Atp11aP98197 1187 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Scnn1aQ61180 699 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 6820408C15RikQ8BJX2 354 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Kbtbd13Q8C828 458 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trex1Q91XB0 314 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cbx8Q9QXV1 362 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ttc38A3KMP2 465 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem59lQ7TNI2 337 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pspc1Q8R326 523 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lrrc8cQ8R502 803 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PplQ9R269 1755 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rnf123Q5XPI3 1314 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pramel3A2AHA7 463 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm7903A2AWL1 463 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 AV320801A2AWL3 467 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gimap9G3X987 291 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm15023L7MUB4 467 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Clcn6O35454 870 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ess2O70279 479 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 RaraP11416 462 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gja8P28236 440 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ephb4P54761 987 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ttbk2Q3UVR3 1243 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trim9Q8C7M3 817 aa18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tor1aip1Q921T2 595 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Znf827Q505G8 1078 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pnma3Q8JZW8 466 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 AticQ9CWJ9 592 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Psmg1Q9JK23 289 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ercc4Q9QZD4 917 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sesn2P58043 480 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Chp1P61022 195 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Miga1Q4QQM5 600 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Asap3Q5U464 904 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trpc6Q61143 930 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mapk4Q6P5G0 583 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tlr13Q6R5N8 991 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tsen34Q8BMZ5 316 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Taf12Q8VE65 161 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc35f6Q8VE96 372 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Q922C1 641 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Art2bO35975 289 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rfc1P35601 1131 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Spata5Q3UMC0 893 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc30a9Q5IRJ6 567 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zbtb17Q60821 794 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ubxn2aQ99KJ0 258 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sgk1Q9WVC6 431 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Eif2ak1Q9Z2R9 619 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Frmd7A2AD83 703 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rab20P35295 233 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cdc25aP48964 514 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Esyt2Q3TZZ7 845 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zbtb16Q3UQ17 673 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tigd5Q499M4 642 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 1810065E05RikQ5NC41 235 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 AlcamQ61490 583 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Scaf8Q6DID3 1268 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Spata32Q8C5V0 334 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lman1lQ8VCD3 505 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vps33aQ9D2N9 598 aa18.24■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ap5z1Q3U829 807 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 4930449I24RikQ9D5E3 319 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 1700016D06RikQ9DAA5 166 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cd2apQ9JLQ0 637 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rps6ka2Q9WUT3 733 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mmrn1B2RPV6 1210 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lrig2Q52KR2 1054 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ankrd45Q810N6 248 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tlcd1Q99JT6 247 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tsc1Q9EP53 1161 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Serpini1O35684 410 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gjb4Q02738 266 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Aak1Q3UHJ0 959 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 OcrlQ6NVF0 900 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dcaf15Q6PFH3 600 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cep104Q80V31 926 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Q80ZQ3 298 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Herc3A6H6S0 1050 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sh2d4bA6X942 431 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rgs22G3UYX5 1258 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Exoc4O35382 975 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 GpiP06745 558 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 YwhagP61982 247 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cfap52Q5F201 620 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Stxbp2Q64324 593 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 GancQ8BVW0 898 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Atxn7Q8R4I1 867 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc44a4Q91VA1 707 aa18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.3 ms