Protein–RNA interactions for Protein: B2RPV6

Mmrn1, Multimerin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmrn1B2RPV6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
Mmrn1B2RPV6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,43■■■■□ 3,26
Mmrn1B2RPV6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,5■■■■□ 3,11
Mmrn1B2RPV6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Mmrn1B2RPV6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,54■■■□□ 2,96
Mmrn1B2RPV6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Mmrn1B2RPV6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Mmrn1B2RPV6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Mmrn1B2RPV6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Mmrn1B2RPV6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Mmrn1B2RPV6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Mmrn1B2RPV6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Mmrn1B2RPV6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Mmrn1B2RPV6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Mmrn1B2RPV6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Mmrn1B2RPV6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,66■■■□□ 2,66
Mmrn1B2RPV6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,61■■■□□ 2,65
Mmrn1B2RPV6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Mmrn1B2RPV6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Mmrn1B2RPV6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Mmrn1B2RPV6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Mmrn1B2RPV6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,15■■■□□ 2,58
Mmrn1B2RPV6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Mmrn1B2RPV6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Mmrn1B2RPV6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Mmrn1B2RPV6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Mmrn1B2RPV6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Mmrn1B2RPV6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Mmrn1B2RPV6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,64■■■□□ 2,5
Mmrn1B2RPV6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Mmrn1B2RPV6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Mmrn1B2RPV6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Mmrn1B2RPV6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Mmrn1B2RPV6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Mmrn1B2RPV6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,48■■■□□ 2,47
Mmrn1B2RPV6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Mmrn1B2RPV6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Mmrn1B2RPV6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,27■■■□□ 2,44
Mmrn1B2RPV6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Mmrn1B2RPV6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Mmrn1B2RPV6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Mmrn1B2RPV6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Mmrn1B2RPV6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Mmrn1B2RPV6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Mmrn1B2RPV6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Mmrn1B2RPV6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,98■■■□□ 2,39
Mmrn1B2RPV6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Mmrn1B2RPV6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Mmrn1B2RPV6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Mmrn1B2RPV6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Mmrn1B2RPV6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Mmrn1B2RPV6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Mmrn1B2RPV6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Mmrn1B2RPV6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Mmrn1B2RPV6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,63■■■□□ 2,33
Mmrn1B2RPV6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Mmrn1B2RPV6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Mmrn1B2RPV6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Mmrn1B2RPV6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Mmrn1B2RPV6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Mmrn1B2RPV6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Mmrn1B2RPV6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Mmrn1B2RPV6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,34■■■□□ 2,29
Mmrn1B2RPV6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Mmrn1B2RPV6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Mmrn1B2RPV6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Mmrn1B2RPV6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Mmrn1B2RPV6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Mmrn1B2RPV6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Mmrn1B2RPV6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Mmrn1B2RPV6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Mmrn1B2RPV6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Mmrn1B2RPV6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Mmrn1B2RPV6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,04■■■□□ 2,24
Mmrn1B2RPV6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Mmrn1B2RPV6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Mmrn1B2RPV6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Mmrn1B2RPV6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Mmrn1B2RPV6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Mmrn1B2RPV6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Mmrn1B2RPV6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Mmrn1B2RPV6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Mmrn1B2RPV6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Mmrn1B2RPV6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Mmrn1B2RPV6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Mmrn1B2RPV6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Mmrn1B2RPV6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Mmrn1B2RPV6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Mmrn1B2RPV6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Mmrn1B2RPV6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,15
Mmrn1B2RPV6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Mmrn1B2RPV6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Mmrn1B2RPV6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Mmrn1B2RPV6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Mmrn1B2RPV6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Mmrn1B2RPV6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Mmrn1B2RPV6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Mmrn1B2RPV6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Mmrn1B2RPV6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Mmrn1B2RPV6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms