Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
Gjb6P70689 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Gjb6P70689 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Gjb6P70689 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Gjb6P70689 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Gjb6P70689 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Gjb6P70689 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Gjb6P70689 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Gjb6P70689 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Gjb6P70689 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Gjb6P70689 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Gjb6P70689 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Gjb6P70689 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Gjb6P70689 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gjb6P70689 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Gjb6P70689 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Gjb6P70689 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Gjb6P70689 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Gjb6P70689 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Gjb6P70689 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Gjb6P70689 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Gjb6P70689 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Gjb6P70689 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Gjb6P70689 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Gjb6P70689 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Gjb6P70689 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gjb6P70689 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Gjb6P70689 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Gjb6P70689 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Gjb6P70689 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Gjb6P70689 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Gjb6P70689 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Gjb6P70689 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gjb6P70689 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Gjb6P70689 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Gjb6P70689 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Gjb6P70689 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gjb6P70689 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Gjb6P70689 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Gjb6P70689 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Gjb6P70689 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Gjb6P70689 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Gjb6P70689 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Gjb6P70689 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Gjb6P70689 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Gjb6P70689 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Gjb6P70689 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Gjb6P70689 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Gjb6P70689 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Gjb6P70689 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gjb6P70689 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Gjb6P70689 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Gjb6P70689 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Gjb6P70689 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Gjb6P70689 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Gjb6P70689 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Gjb6P70689 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Gjb6P70689 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Gjb6P70689 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Gjb6P70689 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Gjb6P70689 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gjb6P70689 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gjb6P70689 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gjb6P70689 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gjb6P70689 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Gjb6P70689 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Gjb6P70689 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Gjb6P70689 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Gjb6P70689 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gjb6P70689 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gjb6P70689 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gjb6P70689 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gjb6P70689 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gjb6P70689 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Gjb6P70689 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gjb6P70689 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gjb6P70689 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Gjb6P70689 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Gjb6P70689 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gjb6P70689 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gjb6P70689 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gjb6P70689 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gjb6P70689 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gjb6P70689 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Gjb6P70689 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gjb6P70689 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gjb6P70689 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gjb6P70689 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gjb6P70689 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gjb6P70689 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gjb6P70689 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gjb6P70689 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gjb6P70689 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gjb6P70689 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gjb6P70689 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gjb6P70689 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gjb6P70689 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gjb6P70689 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gjb6P70689 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gjb6P70689 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms