RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021278.13

Ctc1-201, Transcript of CST complex subunit CTC1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctc1, Length 4,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rab17P35292 214 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 PpardP35396 440 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 AdkP55264 361 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Meis3P97368 378 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sh3gl2Q62420 352 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 WlsQ6DID7 541 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pex5lQ8C437 567 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Aldh1l2Q8K009 923 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ssx2ipQ8VC66 615 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Astn2Q80Z10 1352 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm21149A0A0G2JFY7 255 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Speer4eK7N6S8 255 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm17019K7N6W5 255 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Magea1O89006 320 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Magea5O89009 320 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Hoxc9P09633 260 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Carmil2Q3V3V9 1296 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sec23ipQ6NZC7 998 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Arhgap10Q6Y5D8 786 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mettl13Q91YR5 698 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Magea2Q9R2A2 320 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Psma7Q9Z2U0 248 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ppp1r9aH3BJD6 1292 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Metap2O08663 478 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Msh2P43247 935 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Calb2Q08331 271 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 JrkQ60976 557 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ddx3xQ62167 662 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Catsper3Q80W99 395 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Q8CD60 292 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fermt2Q8CIB5 680 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Otud7aQ8R554 926 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pcdha12Q91Y18 950 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rnf138rt1Q9D9M9 248 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cib4Q9D9N5 185 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Copb1Q9JIF7 953 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rasgrp2Q9QUG9 608 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa9.99□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Plekhg4A0A1L1SU27 1217 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm340F6RGI3 1242 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CrcpO35427 148 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sptlc1O35704 473 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pak1O88643 545 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc4a1P04919 929 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Atxn10P28658 475 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ubxn2bQ0KL01 331 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Patl1Q3TC46 770 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lin7aQ8JZS0 233 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Atp6v1c1Q9Z1G3 382 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nfxl1E9Q8I7 918 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Phldb3E9QAF4 648 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ebf2O08792 575 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 FxnO35943 207 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Kpnb1P70168 876 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pde4dQ01063 747 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nlrp14Q6B966 993 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lrrc24Q8BHA1 521 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Enox1Q8BHR2 643 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Usp1Q8BJQ2 784 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dclk3Q8BWQ5 790 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc26a7Q8R2Z3 656 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ssfa2Q922B9 1252 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dctn2Q99KJ8 402 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Acsl3Q9CZW4 720 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Polr3cQ9D483 533 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tsc1Q9EP53 1161 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ltbp1Q8CG19 1712 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 NktrP30415 1453 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ttll7A4Q9F0 912 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slfn9B1ARD6 910 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 MarcksP26645 309 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Adssl1P28650 457 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Kcnd1Q03719 651 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Hdac4Q6NZM9 1076 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Smg5Q6ZPY2 1017 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dhx38Q80X98 1228 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lyve1Q8BHC0 318 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Klc3Q91W40 508 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 BrapQ99MP8 591 aa9.98□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Trappc3O55013 180 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ms4a2P20490 235 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dnm2P39054 870 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ephb4P54761 987 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 SlmapQ3URD3 845 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ccdc189Q6NZQ0 333 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 LzicQ8K3C3 190 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lgi2Q8K4Z0 550 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mis18aQ9CZJ6 204 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Carmil3Q3UFQ8 1375 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Shank2Q80Z38 1476 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Esp31A8R0W3 114 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Kcnk16G5E845 292 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm7942L7N277 499 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zap70P43404 618 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gsdmc4Q3TR54 480 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.4 ms