Protein–RNA interactions for Protein: G5E845

Kcnk16, MCG5959, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk16G5E845 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Kcnk16G5E845 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Kcnk16G5E845 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Kcnk16G5E845 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Kcnk16G5E845 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Kcnk16G5E845 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Kcnk16G5E845 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Kcnk16G5E845 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Kcnk16G5E845 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kcnk16G5E845 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Kcnk16G5E845 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Kcnk16G5E845 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Kcnk16G5E845 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Kcnk16G5E845 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Kcnk16G5E845 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Kcnk16G5E845 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Kcnk16G5E845 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Kcnk16G5E845 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Kcnk16G5E845 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Kcnk16G5E845 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Kcnk16G5E845 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Kcnk16G5E845 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kcnk16G5E845 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Kcnk16G5E845 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Kcnk16G5E845 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Kcnk16G5E845 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Kcnk16G5E845 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Kcnk16G5E845 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Kcnk16G5E845 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Kcnk16G5E845 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Kcnk16G5E845 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kcnk16G5E845 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kcnk16G5E845 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kcnk16G5E845 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kcnk16G5E845 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kcnk16G5E845 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Kcnk16G5E845 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kcnk16G5E845 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kcnk16G5E845 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Kcnk16G5E845 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Kcnk16G5E845 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Kcnk16G5E845 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Kcnk16G5E845 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kcnk16G5E845 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Kcnk16G5E845 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kcnk16G5E845 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kcnk16G5E845 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kcnk16G5E845 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kcnk16G5E845 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kcnk16G5E845 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Kcnk16G5E845 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kcnk16G5E845 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kcnk16G5E845 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kcnk16G5E845 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Kcnk16G5E845 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Kcnk16G5E845 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kcnk16G5E845 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kcnk16G5E845 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kcnk16G5E845 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Kcnk16G5E845 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kcnk16G5E845 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kcnk16G5E845 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kcnk16G5E845 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kcnk16G5E845 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kcnk16G5E845 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kcnk16G5E845 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kcnk16G5E845 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kcnk16G5E845 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kcnk16G5E845 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Kcnk16G5E845 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kcnk16G5E845 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kcnk16G5E845 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kcnk16G5E845 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kcnk16G5E845 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kcnk16G5E845 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kcnk16G5E845 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kcnk16G5E845 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Kcnk16G5E845 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kcnk16G5E845 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kcnk16G5E845 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kcnk16G5E845 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kcnk16G5E845 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kcnk16G5E845 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kcnk16G5E845 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kcnk16G5E845 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kcnk16G5E845 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Kcnk16G5E845 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kcnk16G5E845 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kcnk16G5E845 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcnk16G5E845 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kcnk16G5E845 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kcnk16G5E845 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kcnk16G5E845 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kcnk16G5E845 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kcnk16G5E845 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kcnk16G5E845 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kcnk16G5E845 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kcnk16G5E845 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kcnk16G5E845 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kcnk16G5E845 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms