RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CnstQ8CBC4 711 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Spata2Q8K004 515 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Golph3Q9CRA5 298 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mrvi1Q9WUX5 899 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ap1b1O35643 943 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.2
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rsad1Q5SUV1 442 aa28.76■■■□□ 2.2
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Luc7lQ9CYI4 371 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.2
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ttll10A4Q9F3 704 aa28.76■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trappc11B2RXC1 1133 aa28.76■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gjc1P28229 396 aa28.76■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lrriq3Q14DL3 633 aa28.76■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mcm5P49718 733 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Enox2Q8R0Z2 598 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tut1Q8R3F9 869 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sec24cG3X972 1096 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc27a3O88561 667 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 FosP01101 380 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cct5P80316 541 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rbm46P86049 533 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tigd5Q499M4 642 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adgrg6Q6F3F9 1165 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmc3Q7TQ69 1130 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ube2sQ921J4 223 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rnf34Q99KR6 376 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Phtf1Q9QZ09 761 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slfn14V9GXG1 899 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Grik5Q61626 979 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 BcrQ6PAJ1 1270 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp27Q8CEG8 438 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Scyl2Q8CFE4 930 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Anapc4Q91W96 807 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trex1Q91XB0 314 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ribc1Q9D0B8 379 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nxnl2Q9D531 156 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp14Q9JMA1 493 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arfgap2Q99K28 520 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ifi202Q9R002 445 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nap1l1P28656 391 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PltpP55065 493 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Muc3aQ3U5A2 218 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hdhd2Q3UGR5 259 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pstpip2Q99M15 334 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mmp14P53690 582 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nhej1Q3KNJ2 295 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rapgef1Q3UHC1 1224 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 P2ry10Q8BFU7 328 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgef7Q9ES28 862 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 H6pdQ8CFX1 789 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ago4Q8CJF8 861 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfpm1O35615 995 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kcnu1O54982 1121 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rgl1Q60695 768 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krt31Q61765 416 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Swap70Q6A028 585 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q91Z58 1206 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Stx17Q9D0I4 301 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pabpc6Q9D4E6 643 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tjp2Q9Z0U1 1167 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ly75Q60767 1723 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp31E9Q6Y8 1344 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nmt1O70310 496 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Peg10Q7TN75 958 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rad51bO35719 350 aa28.71■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Epha7Q61772 998 aa28.71■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krt74Q6IFZ9 495 aa28.71■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Snip1Q8BIZ6 383 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Smco2Q9DA21 347 aa28.71■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Klra9Q2TJJ8 266 aa28.71■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dph1Q5NCQ5 438 aa28.71■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PnocQ64387 187 aa28.71■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cct8l1Q80YT3 562 aa28.71■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Il17cQ8K4C5 194 aa28.71■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Acat1Q8QZT1 424 aa28.71■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 4921524L21RikQ9D5T2 438 aa28.71■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eya4Q9Z191 616 aa28.71■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Btaf1E9QAE3 1848 aa28.7■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tnfrsf11aO35305 625 aa28.7■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hsd17b1P51656 344 aa28.7■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Traf5P70191 558 aa28.7■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc10a5Q5PT54 434 aa28.7■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 SugctQ7TNE1 436 aa28.7■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tcp10aQ80W76 438 aa28.7■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cwc15Q9JHS9 229 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Scarf1Q5ND28 820 aa28.7■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Six2Q62232 296 aa28.7■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krt42Q6IFX2 452 aa28.7■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Phf20Q8BLG0 1010 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Havcr2Q8VIM0 281 aa28.7■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm38392E9Q2A2 434 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sema4dO09126 861 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Insm1Q63ZV0 521 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc113Q8C5T8 377 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cmtm5Q9D6G9 156 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 EmcnQ9R0H2 261 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Akr1b10G5E895 316 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mmp15O54732 657 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Akap2O54931 893 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hoxa11P31311 313 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kiaa1211Q5PR69 1207 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gngt1Q61012 74 aa28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13 ms