Protein–RNA interactions for Protein: Q61772

Epha7, Ephrin type-A receptor 7, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha7Q61772 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
Epha7Q61772 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Epha7Q61772 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Epha7Q61772 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Epha7Q61772 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Epha7Q61772 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Epha7Q61772 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Epha7Q61772 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Epha7Q61772 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Epha7Q61772 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Epha7Q61772 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Epha7Q61772 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Epha7Q61772 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Epha7Q61772 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Epha7Q61772 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Epha7Q61772 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Epha7Q61772 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Epha7Q61772 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Epha7Q61772 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Epha7Q61772 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Epha7Q61772 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Epha7Q61772 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Epha7Q61772 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Epha7Q61772 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Epha7Q61772 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Epha7Q61772 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Epha7Q61772 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Epha7Q61772 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Epha7Q61772 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Epha7Q61772 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Epha7Q61772 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Epha7Q61772 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Epha7Q61772 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Epha7Q61772 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Epha7Q61772 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Epha7Q61772 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Epha7Q61772 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Epha7Q61772 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Epha7Q61772 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Epha7Q61772 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Epha7Q61772 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Epha7Q61772 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Epha7Q61772 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Epha7Q61772 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Epha7Q61772 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Epha7Q61772 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Epha7Q61772 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Epha7Q61772 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Epha7Q61772 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Epha7Q61772 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Epha7Q61772 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Epha7Q61772 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Epha7Q61772 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Epha7Q61772 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Epha7Q61772 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Epha7Q61772 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Epha7Q61772 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Epha7Q61772 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Epha7Q61772 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Epha7Q61772 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Epha7Q61772 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Epha7Q61772 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Epha7Q61772 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Epha7Q61772 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Epha7Q61772 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Epha7Q61772 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Epha7Q61772 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Epha7Q61772 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Epha7Q61772 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Epha7Q61772 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Epha7Q61772 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Epha7Q61772 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Epha7Q61772 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Epha7Q61772 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Epha7Q61772 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Epha7Q61772 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Epha7Q61772 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Epha7Q61772 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Epha7Q61772 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Epha7Q61772 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Epha7Q61772 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Epha7Q61772 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Epha7Q61772 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Epha7Q61772 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Epha7Q61772 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Epha7Q61772 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Epha7Q61772 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Epha7Q61772 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Epha7Q61772 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Epha7Q61772 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Epha7Q61772 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Epha7Q61772 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Epha7Q61772 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Epha7Q61772 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Epha7Q61772 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Epha7Q61772 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Epha7Q61772 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Epha7Q61772 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Epha7Q61772 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Epha7Q61772 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms