Protein–RNA interactions for Protein: Q99K28

Arfgap2, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap2Q99K28 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Arfgap2Q99K28 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Arfgap2Q99K28 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Arfgap2Q99K28 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Arfgap2Q99K28 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Arfgap2Q99K28 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Arfgap2Q99K28 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Arfgap2Q99K28 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Arfgap2Q99K28 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Arfgap2Q99K28 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Arfgap2Q99K28 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Arfgap2Q99K28 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Arfgap2Q99K28 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Arfgap2Q99K28 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Arfgap2Q99K28 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Arfgap2Q99K28 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Arfgap2Q99K28 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Arfgap2Q99K28 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Arfgap2Q99K28 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Arfgap2Q99K28 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Arfgap2Q99K28 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Arfgap2Q99K28 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Arfgap2Q99K28 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Arfgap2Q99K28 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Arfgap2Q99K28 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Arfgap2Q99K28 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Arfgap2Q99K28 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Arfgap2Q99K28 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Arfgap2Q99K28 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Arfgap2Q99K28 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Arfgap2Q99K28 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Arfgap2Q99K28 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Arfgap2Q99K28 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Arfgap2Q99K28 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Arfgap2Q99K28 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Arfgap2Q99K28 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Arfgap2Q99K28 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Arfgap2Q99K28 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Arfgap2Q99K28 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Arfgap2Q99K28 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Arfgap2Q99K28 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Arfgap2Q99K28 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Arfgap2Q99K28 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Arfgap2Q99K28 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Arfgap2Q99K28 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Arfgap2Q99K28 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Arfgap2Q99K28 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Arfgap2Q99K28 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Arfgap2Q99K28 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Arfgap2Q99K28 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Arfgap2Q99K28 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Arfgap2Q99K28 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Arfgap2Q99K28 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Arfgap2Q99K28 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Arfgap2Q99K28 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Arfgap2Q99K28 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Arfgap2Q99K28 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Arfgap2Q99K28 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Arfgap2Q99K28 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Arfgap2Q99K28 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Arfgap2Q99K28 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Arfgap2Q99K28 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Arfgap2Q99K28 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Arfgap2Q99K28 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Arfgap2Q99K28 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Arfgap2Q99K28 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Arfgap2Q99K28 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Arfgap2Q99K28 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Arfgap2Q99K28 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Arfgap2Q99K28 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Arfgap2Q99K28 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Arfgap2Q99K28 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Arfgap2Q99K28 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Arfgap2Q99K28 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Arfgap2Q99K28 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Arfgap2Q99K28 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Arfgap2Q99K28 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Arfgap2Q99K28 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Arfgap2Q99K28 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Arfgap2Q99K28 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Arfgap2Q99K28 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Arfgap2Q99K28 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Arfgap2Q99K28 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Arfgap2Q99K28 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Arfgap2Q99K28 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Arfgap2Q99K28 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Arfgap2Q99K28 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Arfgap2Q99K28 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Arfgap2Q99K28 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Arfgap2Q99K28 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Arfgap2Q99K28 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Arfgap2Q99K28 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Arfgap2Q99K28 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Arfgap2Q99K28 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Arfgap2Q99K28 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Arfgap2Q99K28 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Arfgap2Q99K28 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Arfgap2Q99K28 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Arfgap2Q99K28 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Arfgap2Q99K28 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms