RNA–Protein interactions for RNA: YPL147W

PXA1, Transcript of Subunit of a heterodimeric peroxisomal ABC transport complex, yeast

Gene PXA1, Length 2,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria, Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PXA1	YPL147W	TUL1	P36096	758 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	MRPL4	P36517	319 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	MAL33	P38157	468 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YBP1	P38315	674 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	POP4	P38336	279 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	PCA1	P38360	1216 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	AIM18	P38884	321 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	NBP35	P52920	328 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	UFD1	P53044	361 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	MTQ1	P53944	314 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	SAE3	P89114	91 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	ECM9	Q02202	377 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	SSY1	Q03770	852 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	RAX1	Q08760	435 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	RDR1	Q08904	546 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	NSL1	Q12143	216 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YIL177C	P40434	1758 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YJL225C	P40889	1758 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	DST1	P07273	309 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YUR1	P26725	428 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	RRT2	P38332	387 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	ICP55	P40051	511 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	GDS1	P41913	522 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	SIP4	P46954	829 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	RPC17	P47076	161 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	TAH11	P47112	604 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	PHB2	P50085	310 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	PPT1	P53043	513 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YIP3	P53633	176 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	FMP42	Q04991	504 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	POM33	Q12164	279 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	INO1	P11986	533 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	SPT10	P35208	640 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	RMD6	P39975	231 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	GIP2	P40036	548 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	DIA3	P52290	468 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	TAD1	P53065	400 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	LDB18	Q07887	179 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	SNF3	P10870	884 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	VPS33	P20795	691 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	CLG1	P35190	452 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	RBG1	P39729	369 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	UBP5	P39944	805 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	EAF5	P39995	279 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	POG1	P40473	351 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	OCA2	P53949	197 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	PEX13	P80667	386 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	PLM2	Q04383	521 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	YPR109W	Q06104	294 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	AIM41	Q12032	185 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	HTB2	P02294	131 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	TPK2	P06245	380 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	MET2	P08465	486 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	GCN3	P14741	305 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	CBS2	P14905	389 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	SHP1	P34223	423 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	RCN1	P36054	211 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	ECM31	P38122	312 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.7	□□□□□ -1.66	not detected
PXA1	YPL147W	SHR5	P41912	237 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	IRC5	P43610	853 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	DYN2	Q02647	92 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PXA1	YPL147W	UBP16	Q02863	499 aa		4.7	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.2 ms