RNA–Protein interactions for RNA: YLR141W

RRN5, Transcript of Protein involved in transcription of rDNA by RNA polymerase I, yeast

Gene RRN5, Length 1,092 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN5	YLR141W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	CUP9	P41817	306 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	DYN3	Q04949	312 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	TPO4	Q12256	659 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	SEC62	P21825	274 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	CPR3	P25719	182 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	SEF1	P34228	1148 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	TRM5	P38793	499 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	MAL11	P53048	616 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	YMR210W	Q03649	449 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	REH1	Q06709	432 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	COS7	Q07788	383 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	YLR036C	Q07986	203 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	RAX1	Q08760	435 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	RPB5	P20434	215 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	BUD14	P27637	709 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	PAC10	P48363	199 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	SPT20	P50875	604 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	RAD33	Q04231	177 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	HSP31	Q04432	237 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	SKS1	Q12505	502 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	MEC1	P38111	2368 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	YBR139W	P38109	508 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	MIG2	P53035	382 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	SPC24	Q04477	213 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	YPR172W	Q06608	200 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	FDH1	Q08911	376 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	REX3	Q12090	404 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	BET3	P36149	193 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	IFA38	P38286	347 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	TRR2	P38816	342 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	YHR177W	P38867	453 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	SER3	P40054	469 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	RIC1	P40395	1056 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	GGA1	Q06336	557 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	YPR091C	Q06833	770 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	YIG1	Q08956	461 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	SAN1	P22470	610 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	MRPS18	P42847	217 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	NNF2	P53253	936 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	GTB1	Q04924	702 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	YOR365C	Q08844	703 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRN5	YLR141W	AAC3	P18238	307 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	NAM9	P27929	486 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	KEL2	P50090	882 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	ROM1	P53046	1155 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	YGR067C	P53243	804 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	YDR476C	Q03362	224 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	SMA2	Q04658	369 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	BSC1	Q12140	328 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	MEF1	P25039	761 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	FES1	P38260	290 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	RCK1	P38622	512 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	FAD1	P38913	306 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	PZF1	P39933	429 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	LAS21	P40367	830 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	SNO3	P43544	222 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	YJR115W	P47152	169 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	NUP53	Q03790	475 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	GPI12	P23797	304 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	ATP7	P30902	174 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	VPS51	P36116	164 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	YJL068C	P40363	299 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	GTR1	Q00582	310 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	OSW1	Q08692	278 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	MUM3	Q08750	479 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	ATG14	P38270	344 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	MTW1	P39731	289 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	QDR2	P40474	542 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	TPC1	P53257	314 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	MFG1	Q07684	458 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	TMS1	Q12116	473 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	MMP1	Q12372	583 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	MKK1	P32490	508 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	SEA4	P38164	1038 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRN5	YLR141W	ALG3	P38179	458 aa		13.41	□□□□□ -0.26

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