RNA–Protein interactions for RNA: YFR009W

GCN20, Transcript of Positive regulator of the Gcn2p kinase activity, yeast

Gene GCN20, Length 2,259 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GCN20	YFR009W	PFA3	P42836	336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	EMC4	P53073	190 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	CPR8	P53728	308 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	GRX5	Q02784	150 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	SWF1	Q04629	336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	GPR1	Q12361	961 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	PBS2	P08018	668 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	KIN3	P22209	435 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	TRX3	P25372	127 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	DSF2	P38213	736 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	ATG14	P38270	344 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	YHR033W	P38690	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	GGC1	P38988	300 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	YEL073C	P39974	107 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	PCL6	P40038	420 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	LAS21	P40367	830 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	SSU1	P41930	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	HMS2	P47175	358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	YPS7	Q06325	596 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	TEN1	Q07921	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	DIN7	Q12086	430 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	ACF2	Q12168	779 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	SAM35	P14693	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	ARE1	P25628	610 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	YJU3	P28321	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
GCN20	YFR009W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	HIR2	P32480	875 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	SCO2	P38072	301 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	RCY1	P39531	840 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	FMP10	P40098	244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	GCV1	P48015	400 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	PAC10	P48363	199 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	MSE1	P48525	536 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	RTS3	P53289	263 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	YSA1	Q01976	231 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	MAK3	Q03503	176 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	ARO10	Q06408	635 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	OPT2	Q06593	877 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	TFB4	Q12004	338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	NFI1	Q12216	726 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	ALG7	P07286	448 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	CAP2	P13517	287 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	YSR3	P23501	404 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	PET127	P32606	800 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	SSO1	P32867	290 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	DCW1	P36091	449 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	STP2	P38704	541 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	CCT6	P39079	546 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	IRC6	P43615	237 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	VEL1	P53058	206 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	SDT1	P53078	280 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	RIM13	Q03792	727 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	SIA1	Q12212	622 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	GUT1	P32190	709 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	OAC1	P32332	324 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	SPT14	P32363	452 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	CBP4	P37267	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	MBA1	P38300	278 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	YHK8	P38776	514 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	PEX28	P38848	579 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	YHR177W	P38867	453 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	CTF8	P38877	133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	SER33	P40510	469 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	SER2	P42941	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	YFL066C	P43538	392 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	COS12	P53053	380 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	COG7	P53195	279 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCN20	YFR009W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCN20	YFR009W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GCN20	YFR009W	VPS33	P20795	691 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCN20	YFR009W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GCN20	YFR009W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.1 ms