RNA–Protein interactions for RNA: YER180C-A

SLO1, Transcript of Protein interacting with Arl3p, yeast

Gene SLO1, Length 258 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLO1	YER180C-A	YIL165C	P40446	119 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	BAP3	P41815	604 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	STE24	P47154	453 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	GTO1	P48239	356 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	GOR1	P53839	350 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	REC102	Q02721	264 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	OAZ1	Q02803	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	VPS16	Q03308	798 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	UAF30	Q08747	228 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	HUA2	Q12134	243 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	TRP3	P00937	484 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	APN1	P22936	367 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	STP22	P25604	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	ZIP1	P31111	875 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	YBR139W	P38109	508 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	TED1	P40533	473 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	FMP32	P43557	207 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	MUP1	P50276	574 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	SPT20	P50875	604 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	HOL1	P53389	586 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	YPL071C	Q02864	156 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	YPS7	Q06325	596 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	FMP45	Q07651	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	ESA1	Q08649	445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	MCH5	Q08777	521 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	YOR342C	Q12182	319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	YVC1	Q12324	675 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLO1	YER180C-A	YPR096C	O13587	100 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	ARE1	P25628	610 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	CTS1	P29029	562 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	ATO2	P32907	282 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	FRE2	P36033	711 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	SPC42	P36094	363 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	COS111	P38308	924 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	SHU2	P38957	223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	PTR3	P43606	678 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	TAF6	P53040	516 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	MAL11	P53048	616 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	MSC1	Q03104	513 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	YDR209C	Q03480	137 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	SFH1	Q06168	426 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	VPS74	Q06385	345 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	YLR413W	Q06689	675 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	YOR376W	Q08900	122 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	NSI1	Q12457	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	LSO1	Q3E827	93 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	YOR019W	Q99248	730 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	MRP13	P12686	339 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	STE14	P32584	239 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	MSN2	P33748	704 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	MCM7	P38132	845 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	YBR062C	P38239	180 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	ARN1	P38731	627 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	CHS7	P38843	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	GIP2	P40036	548 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	AYR1	P40471	297 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	PHB1	P40961	287 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	MDV1	P47025	714 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	MRM2	P53123	320 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	YGR067C	P53243	804 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	RPM2	Q02773	1202 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	YPR172W	Q06608	200 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	MLH3	Q12083	715 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	SAS5	Q99314	248 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	SSO1	P32867	290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	BET3	P36149	193 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	OM14	P38325	134 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	TRR2	P38816	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	YIL067C	P40514	678 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	GLO2	Q05584	274 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	YPR091C	Q06833	770 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	CYK3	Q07533	885 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLO1	YER180C-A	YDL218W	Q07629	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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