RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W MPM1P40364 252 aa8.41□□□□□ -1.06
DDI1YER143W ARI1P53111 347 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
DDI1YER143W YDR239CQ03780 787 aa8.41□□□□□ -1.06
DDI1YER143W GAD1Q04792 585 aa8.41□□□□□ -1.06
DDI1YER143W MFB1Q04922 465 aa8.41□□□□□ -1.06
DDI1YER143W REH1Q06709 432 aa8.41□□□□□ -1.06
DDI1YER143W TEN1Q07921 160 aa8.41□□□□□ -1.06
DDI1YER143W MCA1Q08601 432 aa8.41□□□□□ -1.06
DDI1YER143W YDR262WQ12331 272 aa8.41□□□□□ -1.06
DDI1YER143W RKM5Q12367 367 aa8.41□□□□□ -1.06
DDI1YER143W YOL159C-AQ3E769 90 aa8.41□□□□□ -1.06
DDI1YER143W MDM12Q92328 271 aa8.41□□□□□ -1.06
DDI1YER143W CSF1Q12150 2958 aa8.41□□□□□ -1.06
DDI1YER143W ATR1P13090 542 aa8.4□□□□□ -1.06
DDI1YER143W PTP1P25044 335 aa8.4□□□□□ -1.06
DDI1YER143W POL4P25615 582 aa8.4□□□□□ -1.06
DDI1YER143W NTG1P31378 399 aa8.4□□□□□ -1.06
DDI1YER143W SSH4P32343 579 aa8.4□□□□□ -1.06
DDI1YER143W APE2P32454 952 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
DDI1YER143W SUI1P32911 108 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
DDI1YER143W DOA1P36037 715 aa8.4□□□□□ -1.06
DDI1YER143W YHR177WP38867 453 aa8.4□□□□□ -1.06
DDI1YER143W NEO1P40527 1151 aa8.4□□□□□ -1.06
DDI1YER143W PAC11P40960 533 aa8.4□□□□□ -1.06
DDI1YER143W STP3Q05937 343 aa8.4□□□□□ -1.06
DDI1YER143W YLR036CQ07986 203 aa8.4□□□□□ -1.06
DDI1YER143W IRC13Q08630 104 aa8.4□□□□□ -1.06
DDI1YER143W LAG2Q92325 660 aa8.4□□□□□ -1.06
DDI1YER143W RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
DDI1YER143W RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
DDI1YER143W PRO1P32264 428 aa8.39□□□□□ -1.07
DDI1YER143W AIM2P39721 246 aa8.39□□□□□ -1.07
DDI1YER143W GVP36P40531 326 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
DDI1YER143W ELP2P42935 788 aa8.39□□□□□ -1.07
DDI1YER143W BNA3P47039 444 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
DDI1YER143W ESF2P53743 316 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
DDI1YER143W OAZ1Q02803 292 aa8.39□□□□□ -1.07
DDI1YER143W MMT2Q08970 484 aa8.39□□□□□ -1.07
DDI1YER143W YDL199CQ12407 687 aa8.39□□□□□ -1.07
DDI1YER143W POL2P21951 2222 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
DDI1YER143W TIM9O74700 87 aa8.38□□□□□ -1.07
DDI1YER143W PUT2P07275 575 aa8.38□□□□□ -1.07
DDI1YER143W SNF5P18480 905 aa8.38□□□□□ -1.07
DDI1YER143W VPS33P20795 691 aa8.38□□□□□ -1.07
DDI1YER143W YIM1P28625 365 aa8.38□□□□□ -1.07
DDI1YER143W PEP12P32854 288 aa8.38□□□□□ -1.07
DDI1YER143W LHP1P33399 275 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
DDI1YER143W SPC34P36131 295 aa8.38□□□□□ -1.07
DDI1YER143W EHT1P38295 451 aa8.38□□□□□ -1.07
DDI1YER143W MNL1P38888 796 aa8.38□□□□□ -1.07
DDI1YER143W PAC10P48363 199 aa8.38□□□□□ -1.07
DDI1YER143W RHO4Q00246 291 aa8.38□□□□□ -1.07
DDI1YER143W APC4Q04601 652 aa8.38□□□□□ -1.07
DDI1YER143W YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
DDI1YER143W BOP2Q06150 570 aa8.38□□□□□ -1.07
DDI1YER143W RRT8Q08219 342 aa8.38□□□□□ -1.07
DDI1YER143W BSC1Q12140 328 aa8.38□□□□□ -1.07
DDI1YER143W RHO1P06780 209 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
DDI1YER143W FBA1P14540 359 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
DDI1YER143W CBS2P14905 389 aa8.37□□□□□ -1.07
DDI1YER143W MER1P16523 270 aa8.37□□□□□ -1.07
DDI1YER143W RPS1BP23248 255 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
DDI1YER143W MGR1P25573 417 aa8.37□□□□□ -1.07
DDI1YER143W NTH1P32356 751 aa8.37□□□□□ -1.07
DDI1YER143W CDC3P32457 520 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
DDI1YER143W MKK1P32490 508 aa8.37□□□□□ -1.07
DDI1YER143W OMA1P36163 345 aa8.37□□□□□ -1.07
DDI1YER143W FAU1P40099 211 aa8.37□□□□□ -1.07
DDI1YER143W TED1P40533 473 aa8.37□□□□□ -1.07
DDI1YER143W RIM21P48565 533 aa8.37□□□□□ -1.07
DDI1YER143W VMA10P48836 114 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
DDI1YER143W YGR079WP53249 370 aa8.37□□□□□ -1.07
DDI1YER143W RRN11Q04712 507 aa8.37□□□□□ -1.07
DDI1YER143W RQC1Q05468 723 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
DDI1YER143W ISR1Q06098 443 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
DDI1YER143W RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
DDI1YER143W LEU9Q12166 604 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
DDI1YER143W GLO4Q12320 285 aa8.37□□□□□ -1.07
DDI1YER143W COR1P07256 457 aa8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W NPR1P22211 790 aa8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W CLB4P24871 460 aa8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W ARE1P25628 610 aa8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W TAH1P25638 111 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W PTP2P29461 750 aa8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W SRB5P32585 307 aa8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W ATG14P38270 344 aa8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W RIO2P40160 425 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W RPL10P41805 221 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W FET5P43561 622 aa8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W TOM22P49334 152 aa8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W CDH1P53197 566 aa8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W DCP2P53550 970 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W BNA5Q05979 453 aa8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W SPO77Q06134 477 aa8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W DBP9Q06218 594 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W NDL1Q06568 189 aa8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W LOT6Q07923 191 aa8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W PUS7Q08647 676 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W YDL176WQ12027 708 aa8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W PNO1Q99216 274 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.8 ms