RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	MSN2	P33748	704 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	GMH1	P36125	273 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	LDB7	P38210	180 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	LAG1	P38703	411 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	DSS1	P39112	969 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	YAT2	P40017	923 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	PHB2	P50085	310 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	YNL095C	P53932	642 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	ROY1	Q04847	553 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	STB3	Q12427	513 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	PSF1	Q12488	208 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	ATG15	P25641	520 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	ITR2	P30606	609 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	ORC2	P32833	620 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	UBA4	P38820	440 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	COS12	P53053	380 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	USE1	P53146	245 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	SLT2	Q00772	484 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	RIM13	Q03792	727 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	MIX14	Q04341	121 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	XYL2	Q07993	356 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	MET3	P08536	511 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	YAK1	P14680	807 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	SLM4	P38247	162 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	BRE2	P43132	505 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	ULI1	P43604	169 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	TUB4	P53378	473 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	PRM15	Q03262	622 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	YOL131W	Q08270	108 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	ATG31	Q12421	196 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	MET8	P15807	274 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	DSS4	P32601	143 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	SOK1	P40317	901 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	PHO86	P46956	311 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	EMC4	P53073	190 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	SPC19	Q03954	165 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	APC9	Q12107	265 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	CYT1	P07143	309 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	PRB1	P09232	635 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	MRP8	P35719	219 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	ECM27	P47144	725 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	RRN9	P53437	365 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	BUD17	P53727	317 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	YNR068C	P53754	272 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	SNO2	P53823	222 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	MCH5	Q08777	521 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	SOG2	Q08817	791 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	GCN4	P03069	281 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	ATR1	P13090	542 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	PTP2	P29461	750 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	HXT4	P32467	576 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	PDR3	P33200	976 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	RCN1	P36054	211 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	YBR137W	P38276	179 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	BUR6	P40096	142 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	YIG1	Q08956	461 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	APC2	Q12440	853 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	HIP1	P06775	603 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	PDX1	P16451	410 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	CPR2	P23285	205 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	RAD14	P28519	371 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	YHR033W	P38690	423 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	APQ12	P40532	138 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	FKH2	P41813	862 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	YGR201C	P42936	225 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	SSN8	P47821	323 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	RPN14	P53196	417 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	MAK3	Q03503	176 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	NMD4	Q12129	218 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	ACF2	Q12168	779 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	RRI1	Q12468	440 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNF2	YDR093W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.6 ms