RNA–Protein interactions for RNA: YAL017W

PSK1, Transcript of PAS domain-containing serine/threonine protein kinase, yeast

Gene PSK1, Length 4,071 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSK1	YAL017W	YIR016W	P40572	265 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	OPT1	P40897	799 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	YGR210C	P42942	411 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	YFR020W	P43600	232 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	MFM1	Q02783	413 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	FAR8	Q05040	523 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	YOL075C	Q08234	1294 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	SRO7	Q12038	1033 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	OPI3	P05375	206 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	YLL053C	P0CD98	152 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	MAS1	P10507	462 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	SNF6	P18888	332 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	VPS34	P22543	875 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	ZIP1	P31111	875 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	YOX1	P34161	385 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	QDR3	P38227	689 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	ZRG17	P53735	605 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	YAT1	P80235	687 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	YMR209C	Q03648	457 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	IPK1	Q06667	281 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	NSE1	Q07913	336 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	POM34	Q12445	299 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	YMR085W	P0CF18	432 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	CDC23	P16522	626 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	YCR015C	P25616	317 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	MEI4	P29467	408 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	ERG9	P29704	444 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	MET22	P32179	357 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	ERG28	P40030	148 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	SMP3	Q04174	516 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	CDC123	Q05791	360 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	COQ11	Q05892	277 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	CDA2	Q06703	312 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	NCB2	Q92317	146 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	RAD7	P06779	565 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	RHB1	P25378	209 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	SOK1	P40317	901 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	PRM10	P42946	383 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	AGP3	P43548	558 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	VPS60	Q03390	229 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	YDL057W	Q07379	328 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	YOR223W	Q12015	292 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	STE18	P18852	110 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	SPO23	P33757	523 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	SPT10	P35208	640 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	ANS1	P38832	159 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	FHL1	P39521	936 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	YIL001W	P40560	513 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	PTR3	P43606	678 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	RFX1	P48743	811 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	MTL1	P53214	551 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	YGR127W	P53275	312 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	MRS2	Q01926	470 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	PLB2	Q03674	706 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	GIS1	Q03833	894 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	FIN1	Q03898	291 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	SEC10	Q06245	871 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	ARR3	Q06598	404 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	PNS1	Q12412	539 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	DCG1	P32460	244 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	NNK1	P36003	928 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	AIM29	P36154	155 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	RIM13	Q03792	727 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	YMR087W	Q04299	284 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	DDC1	Q08949	612 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	TRM11	Q12463	433 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	COX2	P00410	251 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	KIN82	P25341	720 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	AIM26	P32858	118 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	SPC97	P38863	823 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	SEO1	P39709	593 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	GID8	P40208	455 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	YGL235W	P53071	178 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	MRPS35	P53292	345 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	YGR168C	P53293	376 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	MRPL22	P53881	309 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	REC102	Q02721	264 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PSK1	YAL017W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97

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