RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, human

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3B-215	ENST00000621029	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	IFNAR1	P17181	557 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	KCNJ6	P48051	423 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	EVC	P57679	992 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	ARHGAP4	P98171	946 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	ESYT2	A0FGR8	921 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	CPLX1	O14810	134 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	AR	P10275	920 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	MARK3	P27448	753 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	GNA11	P29992	359 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	NTRK3	Q16288	839 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC9A7	Q96T83	725 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	NBN	O60934	754 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	BAIAP3	O94812	1187 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	RSPH10B	P0C881	870 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	STK3	Q13188	491 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	MCTP2	Q6DN12	878 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	COL6A3	P12111	3177 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	MYOG	P15173	224 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	GPNMB	Q14956	572 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	AZI2	Q9H6S1	392 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	HOXC8	P31273	242 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	BICD2	Q8TD16	824 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	NRCAM	Q92823	1304 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	MEIS1	O00470	390 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	CXCL10	P02778	98 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	CTSH	P09668	335 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPFIA1	Q13136	1202 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	EMSY	Q7Z589	1322 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	KIF28P	B7ZC32	967 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	NFASC	O94856	1347 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SEMA3B-215	ENST00000621029	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADAMTS3	O15072	1205 aa		33.01	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	NLRP5	P59047	1200 aa		33.01	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	ACTR2	P61160	394 aa		33.01	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	IKBKE	Q14164	716 aa		33.01	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		33.01	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	LGR5	O75473	907 aa		33	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	MBTPS1	Q14703	1052 aa		33	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		33	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	UIMC1	Q96RL1	719 aa		33	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		33	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM86B1	E9PN63	330 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	IGBP1	P78318	339 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	GRIK4	Q16099	956 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRPC6	Q9Y210	931 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	CAND2	O75155	1236 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	CA3	P07451	260 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	CYP3A4	P08684	503 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	TLL1	O43897	1013 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	EFCAB14	O75071	495 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	TCTN1	Q2MV58	587 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	TET1	Q8NFU7	2136 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	BACH1	O14867	736 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	DEXI	O95424	95 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	IGFBP4	P22692	258 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	STAT5B	P51692	787 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADAM17	P78536	824 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	DEFB103A	P81534	67 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	PCYT2	Q99447	389 aa		32.96	■■■□□ 2.87

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