RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 NFXL1Q6ZNB6 911 aa28.67■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 APBB2Q92870 758 aa28.67■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 GPRASP2Q96D09 838 aa28.67■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM87BQ96K49 555 aa28.67■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 EPHX3Q9H6B9 360 aa28.67■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 PSTPIP2Q9H939 334 aa28.67■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC69A6NI79 296 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 ATP9AO75110 1047 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 UPP2O95045 317 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 KCNA2P16389 499 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 RPAINQ86UA6 219 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 CDHR1Q96JP9 859 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 ITGB5P18084 799 aa28.65■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 LIFRP42702 1097 aa28.65■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 CHRNA1P02708 482 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 CALM1P0DP23 149 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 CALM2P0DP24 149 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 CALM3P0DP25 149 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 RXRAP19793 462 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 PTPROQ16827 1216 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 LEXMQ3ZCV2 418 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 COL4A6Q14031 1691 aa28.64■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa28.63■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 H3BNC9 293 aa28.63■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 TAF2Q6P1X5 1199 aa28.63■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 RUFY4Q6ZNE9 571 aa28.63■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM192Q8IY95 271 aa28.63■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 SEPT1Q8WYJ6 367 aa28.63■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 KAT6AQ92794 2004 aa28.63■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 SLC27A2O14975 620 aa28.62■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 KCNA5P22460 613 aa28.62■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP28.62■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 EHMT1Q9H9B1 1298 aa28.62■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 ERAP1Q9NZ08 941 aa28.62■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa28.62■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa28.61■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 PPFIA1Q13136 1202 aa28.61■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 GPM6BQ13491 265 aa28.61■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 UBE2SQ16763 222 aa28.61■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 CD320Q9NPF0 282 aa28.61■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 SLC12A7Q9Y666 1083 aa28.61■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 GHRP10912 638 aa28.6■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 MGAT3Q09327 533 aa28.6■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 MTMR1Q13613 665 aa28.6■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 TMTC3Q6ZXV5 915 aa28.6■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa28.6■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 FANCBQ8NB91 859 aa28.6■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 LRFN3Q9BTN0 628 aa28.6■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 SPDYE3A6NKU9 549 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 MAFGO15525 162 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 MARK3P27448 753 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 NECTIN1Q15223 517 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 GRIK4Q16099 956 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 TIGD5Q53EQ6 642 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 CREB3L3Q68CJ9 461 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC82Q8N4S0 544 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 BANK1Q8NDB2 785 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 GLG1Q92896 1179 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 IL17RAQ96F46 866 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 JADE2Q9NQC1 790 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 TUBE1Q9UJT0 475 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHA6Q9UN73 950 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 LPIN1Q14693 890 aa28.58■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 MARCH8Q5T0T0 291 aa28.58■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 RSPH3Q86UC2 560 aa28.58■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC2Q9BYS8 371 aa28.58■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 PKD2L1Q9P0L9 805 aa28.58■■■□□ 2.17
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM31Q5JXX7 168 aa28.57■■■□□ 2.16
PTPRF-216ENST00000617451 SGMS1Q86VZ5 419 aa28.57■■■□□ 2.16
PTPRF-216ENST00000617451 FAM178BQ8IXR5 827 aa28.57■■■□□ 2.16
PTPRF-216ENST00000617451 NEK9Q8TD19 979 aa28.57■■■□□ 2.16
PTPRF-216ENST00000617451 PLA2G5P39877 138 aa28.56■■■□□ 2.16
PTPRF-216ENST00000617451 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
PTPRF-216ENST00000617451 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa28.56■■■□□ 2.16
PTPRF-216ENST00000617451 FIBCD1Q8N539 461 aa28.56■■■□□ 2.16
PTPRF-216ENST00000617451 DNAJB3Q8WWF6 145 aa28.56■■■□□ 2.16
PTPRF-216ENST00000617451 MYO7AQ13402 2215 aa28.55■■■□□ 2.16
PTPRF-216ENST00000617451 PI4K2BG5E9Z4 385 aa28.55■■■□□ 2.16
PTPRF-216ENST00000617451 ENPP3O14638 875 aa28.55■■■□□ 2.16
PTPRF-216ENST00000617451 COL19A1Q14993 1142 aa28.55■■■□□ 2.16
PTPRF-216ENST00000617451 TCEAL5Q5H9L2 206 aa28.55■■■□□ 2.16
PTPRF-216ENST00000617451 FBXO47Q5MNV8 452 aa28.55■■■□□ 2.16
PTPRF-216ENST00000617451 MICU3Q86XE3 530 aa28.55■■■□□ 2.16
PTPRF-216ENST00000617451 PCYT2Q99447 389 aa28.55■■■□□ 2.16
PTPRF-216ENST00000617451 GRXCR2A6NFK2 248 aa28.54■■■□□ 2.16
PTPRF-216ENST00000617451 C5orf67F2Z3F1 127 aa28.54■■■□□ 2.16
PTPRF-216ENST00000617451 GPR37L1O60883 481 aa28.54■■■□□ 2.16
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