RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 POLR3EQ9NVU0 708 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 IL9P15248 144 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 ADCY7P51828 1080 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 TYW1BQ6NUM6 668 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 CLEC4DQ8WXI8 215 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 PSTPIP2Q9H939 334 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 SUGCTQ9HAC7 445 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 LCHNA4D1U4 455 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 SMCO2A6NFE2 343 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 GRXCR2A6NFK2 248 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 H3BQV1 296 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNJ6P48051 423 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM63BQ5T3F8 832 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF318Q5VUA4 2279 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 PIK3CDO00329 1044 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 DTNBO60941 627 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 MMP1P03956 469 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 PURAQ00577 322 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHA4Q9UN74 947 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 TET1Q8NFU7 2136 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 EEPD1Q7L9B9 569 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBED2Q9BTP6 218 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 NFIBO00712 420 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 OPLAHO14841 1288 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 POLR2MP0CAP2 368 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 SYT1P21579 422 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 HSD17B4P51659 736 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 ERVK-21P61565 698 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 DUSP28Q4G0W2 176 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 MUM1L1Q5H9M0 696 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 VTA1Q9NP79 307 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT2P35908 639 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 AP3B2Q13367 1082 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 BFSP2Q13515 415 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM47CQ5HY64 1035 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 BLIDQ8IZY5 108 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNJ14Q9UNX9 436 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 STX6O43752 255 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 FOSP01100 380 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 CPT1AP50416 773 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR5P61964 334 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 NBPF20Q3BBV1 942 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 NFRKBQ6P4R8 1299 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF207Q6ZRF8 634 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 MTUS1Q9ULD2 1270 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPRSQ13332 1948 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 TANC1Q9C0D5 1861 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 CFBP00751 764 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 MYL3P08590 195 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 NPY5RQ15761 445 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 NSMFQ6X4W1 530 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 NEK9Q8TD19 979 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 MORC4Q8TE76 937 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 MFSD14AQ96MC6 490 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 RAD9AQ99638 391 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 MEIS2O14770 477 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 CLK2P49760 499 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 FOSBP53539 338 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 HFE2Q6ZVN8 426 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 EHMT1Q9H9B1 1298 aa26.86■■□□□ 1.89
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CAPNS1-214ENST00000592483 CYP39A1Q9NYL5 469 aa26.86■■□□□ 1.89
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CAPNS1-214ENST00000592483 RPS6P62753 249 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
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CAPNS1-214ENST00000592483 WDR11Q9BZH6 1224 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa26.85■■□□□ 1.89
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CAPNS1-214ENST00000592483 M0R2N6 131 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 GJB5O95377 273 aa26.84■■□□□ 1.89
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CAPNS1-214ENST00000592483 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT25Q7Z3Z0 450 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
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CAPNS1-214ENST00000592483 USP34Q70CQ2 3546 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 DEFB103AP81534 67 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
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