RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 GPRASP2Q96D09 838 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 SLC27A2O14975 620 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 CALM1P0DP23 149 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 CALM2P0DP24 149 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 CALM3P0DP25 149 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 KCNA2P16389 499 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 LIFRP42702 1097 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 TOP1MTQ969P6 601 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 CDHR1Q96JP9 859 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 YME1L1Q96TA2 773 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 NRCAMQ92823 1304 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 ATP9AO75110 1047 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 ITGB5P18084 799 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 FAM26DQ5JW98 314 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 APBB2Q92870 758 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 UBE2SQ16763 222 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 SAMD11Q96NU1 681 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 UPP2O95045 317 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 MTMR1Q13613 665 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 EPC2Q52LR7 807 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 CHRNA1P02708 482 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 MARK3P27448 753 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 PPFIA1Q13136 1202 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 NECTIN1Q15223 517 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 RPAINQ86UA6 219 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 MICU3Q86XE3 530 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAF4-216ENST00000586813 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 PTPROQ16827 1216 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 FANCBQ8NB91 859 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 GHRP10912 638 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 MGAT3Q09327 533 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 GRIK4Q16099 956 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 GLG1Q92896 1179 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 JADE2Q9NQC1 790 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 H3BNC9 293 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 KCNA5P22460 613 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 RSPH3Q86UC2 560 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 TMEM192Q8IY95 271 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 MAFGO15525 162 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 GPM6BQ13491 265 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 LPIN1Q14693 890 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 TTC3P53804 2025 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 APOA5Q6Q788 366 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 BANK1Q8NDB2 785 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 IL17RAQ96F46 866 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 RNF20Q5VTR2 975 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 FIBCD1Q8N539 461 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 PCYT2Q99447 389 aa22.15■■□□□ 1.14
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