RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567312.5

TRAPPC2L-212, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 499 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-212ENST00000567312 LMBR1Q8WVP7 490 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2L-212ENST00000567312 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2L-212ENST00000567312 EVI5LQ96CN4 794 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2L-212ENST00000567312 JMJD4Q9H9V9 463 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2L-212ENST00000567312 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2L-212ENST00000567312 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 EYA4O95677 639 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 GNAT1P11488 350 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 RRP1P56182 461 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 GHRHRQ02643 423 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CAMK1Q14012 370 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 AMNQ9BXJ7 453 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CLEC1BQ9P126 229 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 KDM4AO75164 1064 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 GLP2RO95838 553 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CHRNA1P02708 482 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 DNAJB1P25685 340 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 NRIP1P48552 1158 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 SP4Q02446 784 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 SIGLEC14Q08ET2 396 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 FAM26DQ5JW98 314 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 IQCA1Q86XH1 822 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 EFHBQ8N7U6 833 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 PLVAPQ9BX97 442 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 PLAGL2Q9UPG8 496 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ITGB1P05556 798 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 TGFB3P10600 412 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 COASYQ13057 564 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 LPIN1Q14693 890 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 METTL7BQ6UX53 244 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 FCHSD1Q86WN1 690 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 GPR20Q99678 358 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 USP26Q9BXU7 913 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 MYO15AQ9UKN7 3530 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 B4E1Z4 1266 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ADAM17P78536 824 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 MGAT3Q09327 533 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 P2RX5Q93086 422 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ASIC4Q96FT7 647 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 MYO10Q9HD67 2058 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 VPS13AQ96RL7 3174 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ZBTB5O15062 677 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 DGKIO75912 1065 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 POLR2MP0CAP2 368 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 SEMA3FQ13275 785 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 GNPTABQ3T906 1256 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 HOMER1Q86YM7 354 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 KLHL23Q8NBE8 558 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 SPPL3Q8TCT6 385 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 POF1BQ8WVV4 589 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ENPP3O14638 875 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 FOXK2Q01167 660 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 NEDD9Q14511 834 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 FBXO47Q5MNV8 452 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 TAF2Q6P1X5 1199 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 MTMR8Q96EF0 704 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CDY2AQ9Y6F7 541 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 CACNA1BQ00975 2339 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC2L-212ENST00000567312 NRCAMQ92823 1304 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms