RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559850.5

RABGGTA-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-211ENST00000559850 PRR16Q569H4 304 aa16.89■□□□□ 0.29
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RABGGTA-211ENST00000559850 TRAF7Q6Q0C0 670 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-211ENST00000559850 RUFY4Q6ZNE9 571 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-211ENST00000559850 KRT25Q7Z3Z0 450 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-211ENST00000559850 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-211ENST00000559850 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-211ENST00000559850 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-211ENST00000559850 HERVK_113Q902F9 699 aa16.83■□□□□ 0.28
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