RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559642.1

BMP4-208, Transcript of bone morphogenetic protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene BMP4, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4-208ENST00000559642 NFASCO94856 1347 aa14.68□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.68□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 MAFGO15525 162 aa14.68□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 IQCF3P0C7M6 154 aa14.68□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 NPY5RQ15761 445 aa14.68□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 RASIP1Q5U651 963 aa14.68□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 MCTP2Q6DN12 878 aa14.68□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 NIPA1Q7RTP0 329 aa14.68□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.68□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 CAGE1Q8TC20 777 aa14.68□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 SEPT1Q8WYJ6 367 aa14.68□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 GTF3C6Q969F1 213 aa14.68□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.68□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 PCDHA4Q9UN74 947 aa14.68□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 TREHO43280 583 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 EDIL3O43854 480 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 CCNE2O96020 404 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 FGBP02675 491 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 CKBP12277 381 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 SELPP16109 830 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 HOXC8P31273 242 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 ACTR2P61160 394 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 ST3GAL1Q11201 340 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 PTK7Q13308 1070 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 PRR16Q569H4 304 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 GPR153Q6NV75 609 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 LRRC8DQ7L1W4 858 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 BLIDQ8IZY5 108 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 DEFB123Q8N688 67 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 TET1Q8NFU7 2136 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 AFAP1L1Q8TED9 768 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 LMBR1Q8WVP7 490 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 HERVK_113Q902F9 699 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 GLG1Q92896 1179 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 PCYT2Q99447 389 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 RNPEPQ9H4A4 650 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 SETD4Q9NVD3 440 aa14.67□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 EMSYQ7Z589 1322 aa14.66□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 GRXCR1A8MXD5 290 aa14.66□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 FOSBP53539 338 aa14.66□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 RBL2Q08999 1139 aa14.66□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.66□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 SERINC5Q86VE9 423 aa14.66□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.66□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 TBCKQ8TEA7 893 aa14.66□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 LENG9Q96B70 501 aa14.66□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 FAM161BQ96MY7 647 aa14.66□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 KIF2CQ99661 725 aa14.66□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 KAT6AQ92794 2004 aa14.66□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 PTPRSQ13332 1948 aa14.66□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 SIP14410 1827 aa14.66□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 ZBBXA8MT70 800 aa14.65□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 M0R2N6 131 aa14.65□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 JAK2O60674 1132 aa14.65□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 LGR5O75473 907 aa14.65□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 PFKMP08237 780 aa14.65□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 FDPSP14324 419 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 CIITAP33076 1130 aa14.65□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 RFC2P35250 354 aa14.65□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 THPOP40225 353 aa14.65□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 PPFIA1Q13136 1202 aa14.65□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 GPNMBQ14956 572 aa14.65□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.65□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 ZNF577Q9BSK1 485 aa14.65□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.65□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.65□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa14.65□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.65□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 DHX15O43143 795 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BMP4-208ENST00000559642 NBNO60934 754 aa14.64□□□□□ -0.07
BMP4-208ENST00000559642 TDP2O95551 362 aa14.64□□□□□ -0.07
BMP4-208ENST00000559642 CTSHP09668 335 aa14.64□□□□□ -0.07
BMP4-208ENST00000559642 PBX2P40425 430 aa14.64□□□□□ -0.07
BMP4-208ENST00000559642 IGBP1P78318 339 aa14.64□□□□□ -0.07
BMP4-208ENST00000559642 MBTPS1Q14703 1052 aa14.64□□□□□ -0.07
BMP4-208ENST00000559642 TCTN1Q2MV58 587 aa14.64□□□□□ -0.07
BMP4-208ENST00000559642 ZNF697Q5TEC3 545 aa14.64□□□□□ -0.07
BMP4-208ENST00000559642 OXER1Q8TDS5 423 aa14.64□□□□□ -0.07
BMP4-208ENST00000559642 GJA10Q969M2 543 aa14.64□□□□□ -0.07
BMP4-208ENST00000559642 ZBTB10Q96DT7 871 aa14.64□□□□□ -0.07
BMP4-208ENST00000559642 AZI2Q9H6S1 392 aa14.64□□□□□ -0.07
BMP4-208ENST00000559642 WDR81Q562E7 1941 aa14.64□□□□□ -0.07
BMP4-208ENST00000559642 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BMP4-208ENST00000559642 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BMP4-208ENST00000559642 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BMP4-208ENST00000559642 GNAT1P11488 350 aa14.63□□□□□ -0.07
BMP4-208ENST00000559642 DNAJB2P25686 324 aa14.63□□□□□ -0.07
BMP4-208ENST00000559642 ADAM17P78536 824 aa14.63□□□□□ -0.07
BMP4-208ENST00000559642 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms