RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556867.1

TDP1-216, Transcript of tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TDP1, Length 748 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1-216ENST00000556867 PRR16Q569H4 304 aa25.97■■□□□ 1.75
TDP1-216ENST00000556867 TMEM199Q8N511 208 aa25.97■■□□□ 1.75
TDP1-216ENST00000556867 TANC1Q9C0D5 1861 aa25.96■■□□□ 1.75
TDP1-216ENST00000556867 EMSYQ7Z589 1322 aa25.96■■□□□ 1.75
TDP1-216ENST00000556867 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
TDP1-216ENST00000556867 DHX15O43143 795 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
TDP1-216ENST00000556867 HOXC8P31273 242 aa25.96■■□□□ 1.75
TDP1-216ENST00000556867 EPHB4P54760 987 aa25.96■■□□□ 1.75
TDP1-216ENST00000556867 ACTR2P61160 394 aa25.96■■□□□ 1.75
TDP1-216ENST00000556867 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
TDP1-216ENST00000556867 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.96■■□□□ 1.75
TDP1-216ENST00000556867 WNT8AQ9H1J5 351 aa25.96■■□□□ 1.75
TDP1-216ENST00000556867 LAMA3Q16787 3333 aa25.96■■□□□ 1.75
TDP1-216ENST00000556867 PITPNM1O00562 1244 aa25.95■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 LGR5O75473 907 aa25.95■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa25.95■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa25.95■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 MOXD1Q6UVY6 613 aa25.95■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 OXER1Q8TDS5 423 aa25.95■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 KAT6AQ92794 2004 aa25.95■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa25.94■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.94■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 CSF2RAP15509 400 aa25.94■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 CYP3A7P24462 503 aa25.94■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa25.94■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 BRMS1Q9HCU9 246 aa25.94■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 TBC1D22BQ9NU19 505 aa25.94■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 C17orf102A2RUQ5 167 aa25.93■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 ATG7O95352 703 aa25.93■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 CCNE2O96020 404 aa25.93■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 KRT2P35908 639 aa25.93■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 CCL23P55773 120 aa25.93■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 RBL2Q08999 1139 aa25.93■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 BFSP2Q13515 415 aa25.93■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 HIC1Q14526 733 aa25.93■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 SHHQ15465 462 aa25.93■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 INF2Q27J81 1249 aa25.93■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 LRIT3Q3SXY7 679 aa25.93■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 Q4G0T1 1027 aa25.93■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 C9orf50Q5SZB4 431 aa25.93■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 CCDC155Q8N6L0 562 aa25.93■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 CAGE1Q8TC20 777 aa25.93■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 MBOAT7Q96N66 472 aa25.93■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 PCYT2Q99447 389 aa25.93■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 ERAP1Q9NZ08 941 aa25.93■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 TDP2O95551 362 aa25.92■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 MMP1P03956 469 aa25.92■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 PTK7Q13308 1070 aa25.92■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 TRIM29Q14134 588 aa25.92■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 KRT40Q6A162 431 aa25.92■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 GLG1Q92896 1179 aa25.92■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 TNFRSF25Q93038 417 aa25.92■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 MSH4O15457 936 aa25.91■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 MCM2P49736 904 aa25.91■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 NEK8Q86SG6 692 aa25.91■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 UIMC1Q96RL1 719 aa25.91■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 RNPEPQ9H4A4 650 aa25.91■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 AZI2Q9H6S1 392 aa25.91■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 IL23AQ9NPF7 189 aa25.91■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 SCN5AQ14524 2016 aa25.9■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa25.9■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 GNAT1P11488 350 aa25.9■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 KRT76Q01546 638 aa25.9■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 NR5A1Q13285 461 aa25.9■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 ABHD15Q6UXT9 468 aa25.9■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.9■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 C16orf59Q7L2K0 433 aa25.9■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa25.9■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 SERINC5Q86VE9 423 aa25.9■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 RETREG2Q8NC44 543 aa25.9■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.9■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 SLC5A5Q92911 643 aa25.9■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 SCLYQ96I15 445 aa25.9■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 RIT2Q99578 217 aa25.9■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa25.9■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 NRCAMQ92823 1304 aa25.89■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 MARK3P27448 753 aa25.89■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 FOSBP53539 338 aa25.89■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 ADAM17P78536 824 aa25.89■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 ATP6V0A1Q93050 837 aa25.89■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 TMX3Q96JJ7 454 aa25.89■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 SETD4Q9NVD3 440 aa25.89■■□□□ 1.74
TDP1-216ENST00000556867 WDR81Q562E7 1941 aa25.88■■□□□ 1.73
TDP1-216ENST00000556867 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
TDP1-216ENST00000556867 IQCF3P0C7M6 154 aa25.88■■□□□ 1.73
TDP1-216ENST00000556867 RFC2P35250 354 aa25.88■■□□□ 1.73
TDP1-216ENST00000556867 STAT5BP51692 787 aa25.88■■□□□ 1.73
TDP1-216ENST00000556867 LETM2Q2VYF4 491 aa25.88■■□□□ 1.73
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