RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	FIGN	Q5HY92	759 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM209	Q96SK2	561 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	ACOT7	O00154	380 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	APP	P05067	770 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	KCNA6	P17658	529 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	KRT15	P19012	456 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	KCNC1	P48547	511 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	RTP5	Q14D33	572 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	VASN	Q6EMK4	673 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	CLIC6	Q96NY7	704 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	ASMTL	O95671	621 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF28	P17035	718 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	HOXA5	P20719	270 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	GJA4	P35212	333 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	WRNIP1	Q96S55	665 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	USP35	Q9P2H5	1018 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF839	A8K0R7	811 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	KCNK3	O14649	394 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	NOBOX	O60393	691 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	RFPL3	O75679	317 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	NPTXR	O95502	500 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	CROT	Q9UKG9	612 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	CYP7B1	O75881	506 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	ASL	P04424	464 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	COL6A1	P12109	1028 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	IGFALS	P35858	605 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	GJA9	P57773	515 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	PFKP	Q01813	784 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF460	Q14592	562 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	SEC23A	Q15436	765 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	FANCL	Q9NW38	375 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204		B4E1Z4	1266 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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