RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCNE2O96020 404 aa9.54□□□□□ -0.88
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 POTEBQ6S5H4 581 aa9.53□□□□□ -0.88
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRIB2Q92519 343 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TIGD1Q96MW7 591 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HSD17B14Q9BPX1 270 aa9.53□□□□□ -0.88
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TNMDQ9H2S6 317 aa9.53□□□□□ -0.88
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PTGS1P23219 599 aa9.52□□□□□ -0.89
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARHGAP1Q07960 439 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRIM32Q13049 653 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 E2F4Q16254 413 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DUSP28Q4G0W2 176 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 POTEGQ6S5H5 508 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ABHD15Q6UXT9 468 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SV2BQ7L1I2 683 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NEK9Q8TD19 979 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SEPT1Q8WYJ6 367 aa9.52□□□□□ -0.89
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