RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520376.1

FBXW11-208, Transcript of F-box and WD repeat domain containing 11, human

TSL 2

Gene FBXW11, Length 686 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXW11-208	ENST00000520376	HIC1	Q14526	733 aa		27.57	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		27.57	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		27.56	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	DTNB	O60941	627 aa		27.56	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	HOXC8	P31273	242 aa		27.56	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	RBL2	Q08999	1139 aa		27.56	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	NPY5R	Q15761	445 aa		27.56	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	ZNF365	Q70YC5	407 aa		27.56	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	BLID	Q8IZY5	108 aa		27.56	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	RETREG2	Q8NC44	543 aa		27.56	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		27.56	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	EMSY	Q7Z589	1322 aa		27.56	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	PTK7	Q13308	1070 aa		27.55	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	GALNT17	Q6IS24	598 aa		27.55	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	GPR153	Q6NV75	609 aa		27.55	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		27.55	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	RFC2	P35250	354 aa		27.54	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	KIF2C	Q99661	725 aa		27.54	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		27.54	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		27.54	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	SI	P14410	1827 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376		M0R2N6	131 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	PFKM	P08237	780 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	IQCF3	P0C7M6	154 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	XBP1	P17861	261 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	CIITA	P33076	1130 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	ACTR2	P61160	394 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	PRR16	Q569H4	304 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	RASIP1	Q5U651	963 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	WASF1	Q92558	559 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	WNT8B	Q93098	351 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	VWCE	Q96DN2	955 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	PTPRS	Q13332	1948 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	LGR5	O75473	907 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	SELP	P16109	830 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	ST3GAL1	Q11201	340 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	SERINC5	Q86VE9	423 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	TBCK	Q8TEA7	893 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	HERVK_113	Q902F9	699 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	GLG1	Q92896	1179 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXW11-208	ENST00000520376	FGB	P02675	491 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	CKB	P12277	381 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	MARK3	P27448	753 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	LENG9	Q96B70	501 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	UIMC1	Q96RL1	719 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	PCYT2	Q99447	389 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	SETD4	Q9NVD3	440 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	TREH	O43280	583 aa		27.5	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	EDIL3	O43854	480 aa		27.5	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	CCNE2	O96020	404 aa		27.5	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	GNAT1	P11488	350 aa		27.5	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	USP11	P51784	963 aa		27.5	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		27.5	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	AZI2	Q9H6S1	392 aa		27.5	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		27.5	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	27.49	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	JAK2	O60674	1132 aa		27.49	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	PPFIA1	Q13136	1202 aa		27.49	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	27.49	■■□□□ 1.99	5e-8	■■■■□ 26.1
FBXW11-208	ENST00000520376	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		27.49	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		27.48	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	NRCAM	Q92823	1304 aa		27.48	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	27.48	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		27.48	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	ATG7	O95352	703 aa		27.47	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	ADAM17	P78536	824 aa		27.47	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		27.47	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	27.47	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		27.47	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376		Q7L0L9	218 aa		27.47	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		27.47	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		27.46	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	27.46	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		27.46	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	27.46	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	27.46	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	TDP2	O95551	362 aa		27.46	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	THPO	P40225	353 aa		27.46	■■□□□ 1.99
FBXW11-208	ENST00000520376	GRIK4	Q16099	956 aa		27.46	■■□□□ 1.99

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