RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 UPP2O95045 317 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 TOP1MTQ969P6 601 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 SAMD11Q96NU1 681 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 NEK1Q96PY6 1258 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP9AO75110 1047 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 PPFIA1Q13136 1202 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 UBE2SQ16763 222 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 JADE2Q9NQC1 790 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNA2P16389 499 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 ITGB5P18084 799 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAM17P78536 824 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPROQ16827 1216 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM26DQ5JW98 314 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 AZI2Q9H6S1 392 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPRSQ13332 1948 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 MARK3P27448 753 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 NAPAP54920 295 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB43O43298 467 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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SH3BP2-220ENST00000511663 GRIK4Q16099 956 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 RTN1Q16799 776 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 RPAINQ86UA6 219 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 SDF4Q9BRK5 362 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 COL9A1P20849 921 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 FGD1P98174 961 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 KRT32Q14532 448 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 EPC2Q52LR7 807 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 APOA5Q6Q788 366 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.03■■□□□ 1.12
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SH3BP2-220ENST00000511663 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 KAT6AQ92794 2004 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 CHRNA1P02708 482 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF76P36508 570 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 IGBP1P78318 339 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 IL17RAQ96F46 866 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-220ENST00000511663 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.02■■□□□ 1.12
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SH3BP2-220ENST00000511663 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
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SH3BP2-220ENST00000511663 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.01■■□□□ 1.11
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SH3BP2-220ENST00000511663 FIBCD1Q8N539 461 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-220ENST00000511663 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
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SH3BP2-220ENST00000511663 TRPC6Q9Y210 931 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-220ENST00000511663 SMCO2A6NFE2 343 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-220ENST00000511663 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP2-220ENST00000511663 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP2-220ENST00000511663 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-220ENST00000511663 VCANP13611 3396 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-220ENST00000511663 TTC28Q96AY4 2481 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-220ENST00000511663 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-220ENST00000511663 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.99■■□□□ 1.11
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