RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
ARHGEF3-215ENST00000498517 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
ARHGEF3-215ENST00000498517 DDX11Q96FC9 970 aa6.4□□□□□ -1.38
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC17Q96LX7 622 aa6.4□□□□□ -1.38
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
ARHGEF3-215ENST00000498517 CSRNP1Q96S65 589 aa6.4□□□□□ -1.38
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRRC2Q9BYS8 371 aa6.4□□□□□ -1.38
ARHGEF3-215ENST00000498517 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
ARHGEF3-215ENST00000498517 CABP5Q9NP86 173 aa6.4□□□□□ -1.38
ARHGEF3-215ENST00000498517 INCENPQ9NQS7 918 aa6.4□□□□□ -1.38
ARHGEF3-215ENST00000498517 DACT1Q9NYF0 836 aa6.4□□□□□ -1.38
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ARHGEF3-215ENST00000498517 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.4□□□□□ -1.38
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.4□□□□□ -1.38
ARHGEF3-215ENST00000498517 ECM29Q5VYK3 1845 aa6.4□□□□□ -1.38
ARHGEF3-215ENST00000498517 WDR19Q8NEZ3 1342 aa6.4□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF541Q9H0D2 1346 aa6.4□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CALM1P0DP23 149 aa6.39□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CALM2P0DP24 149 aa6.39□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CALM3P0DP25 149 aa6.39□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 LIFRP42702 1097 aa6.39□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CD97P48960 835 aa6.39□□□□□ -1.39
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ARHGEF3-215ENST00000498517 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.39□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.39□□□□□ -1.39
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.39□□□□□ -1.39
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.39□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.39□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 EHD4Q9H223 541 aa6.39□□□□□ -1.39
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.38□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 SHTN1A0MZ66 631 aa6.38□□□□□ -1.39
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CTDNEP1O95476 244 aa6.38□□□□□ -1.39
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ARHGEF3-215ENST00000498517 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa6.38□□□□□ -1.39
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CYB5R4Q7L1T6 521 aa6.38□□□□□ -1.39
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ARHGEF3-215ENST00000498517 DGKHQ86XP1 1220 aa6.38□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.38□□□□□ -1.39
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
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ARHGEF3-215ENST00000498517 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.38□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 PDCL3Q9H2J4 239 aa6.38□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CBX8Q9HC52 389 aa6.38□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa6.38□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.38□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 STX8Q9UNK0 236 aa6.38□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 NEDD4P46934 1319 aa6.38□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 FOCADQ5VW36 1801 aa6.38□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 NAV1Q8NEY1 1877 aa6.38□□□□□ -1.39
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