RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 GLI4P10075 376 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 FZD5Q13467 585 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM132BQ14DG7 1078 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 RAB3GAP1Q15042 981 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 PLEKHG6Q3KR16 790 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 CPZQ66K79 652 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 PASD1Q8IV76 773 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 NLGN4XQ8N0W4 816 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 COG1Q8WTW3 980 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 SEC14L1Q92503 715 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 MTMR8Q96EF0 704 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 PEX11GQ96HA9 241 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 RIC8BQ9NVN3 520 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 MYOTQ9UBF9 498 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 PALD1Q9ULE6 856 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 SRPK3Q9UPE1 567 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 PAPLNO95428 1278 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 LTFP02788 710 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 DBHP09172 617 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 SLC9A1P19634 815 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 PMLP29590 882 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 LSSP48449 732 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 GRIN1Q05586 938 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 TUSC3Q13454 348 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 FYB2Q5VWT5 728 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 BTBD8Q5XKL5 378 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 PAQR3Q6TCH7 311 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 HHIPL2Q6UWX4 724 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 NETO2Q8NC67 525 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 SH3RF2Q8TEC5 729 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 SHISA4Q96DD7 197 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 YIPF4Q9BSR8 244 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 SMOC1Q9H4F8 434 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 EMC7Q9NPA0 242 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 TOMM22Q9NS69 142 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 PHLDB1Q86UU1 1377 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 SGSM2O43147 1006 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 CYBBP04839 570 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 SLC6A11P48066 632 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 KIF11P52732 1056 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 DDB1Q16531 1140 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 FIGNQ5HY92 759 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 KCTD1Q719H9 257 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 OTOP1Q7RTM1 612 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 TRIM48Q8IWZ4 208 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 POU5F2Q8N7G0 328 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 KIAA1958Q8N8K9 716 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 KLHL42Q9P2K6 505 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 OR14I1A6ND48 311 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 TADA3O75528 432 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 C8AP07357 584 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 PRR5P85299 388 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 NR1I3Q14994 352 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 ODR4Q5SWX8 454 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 FSTL4Q6MZW2 842 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 NECAB2Q7Z6G3 386 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 CNTD1Q8N815 330 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 FLAD1Q8NFF5 587 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 BCAS3Q9H6U6 928 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 ASH2LQ9UBL3 628 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1B-215ENST00000498054 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
POLR1B-215ENST00000498054 TCRBV5S2A0A599 114 aa5.83□□□□□ -1.48
POLR1B-215ENST00000498054 PRAMEF25A6NGN4 478 aa5.83□□□□□ -1.48
POLR1B-215ENST00000498054 SRGAP3O43295 1099 aa5.83□□□□□ -1.48
POLR1B-215ENST00000498054 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
POLR1B-215ENST00000498054 ULK1O75385 1050 aa5.83□□□□□ -1.48
POLR1B-215ENST00000498054 ZBTB7AO95365 584 aa5.83□□□□□ -1.48
POLR1B-215ENST00000498054 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
POLR1B-215ENST00000498054 ERVFRD-1P60508 538 aa5.83□□□□□ -1.48
POLR1B-215ENST00000498054 MTMR1Q13613 665 aa5.83□□□□□ -1.48
POLR1B-215ENST00000498054 KCNMB1Q16558 191 aa5.83□□□□□ -1.48
POLR1B-215ENST00000498054 EMC4Q5J8M3 183 aa5.83□□□□□ -1.48
POLR1B-215ENST00000498054 BROXQ5VW32 411 aa5.83□□□□□ -1.48
POLR1B-215ENST00000498054 CYP4F22Q6NT55 531 aa5.83□□□□□ -1.48
POLR1B-215ENST00000498054 RPTNQ6XPR3 784 aa5.83□□□□□ -1.48
POLR1B-215ENST00000498054 NOSTRINQ8IVI9 506 aa5.83□□□□□ -1.48
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