RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 ATG7O95352 703 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 PARNO95453 639 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 SLC26A2P50443 739 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 ST3GAL1Q11201 340 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 Q4G0T1 1027 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 AZI2Q9H6S1 392 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 PFKMP08237 780 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 RFC2P35250 354 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 KRT2P35908 639 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 KRT76Q01546 638 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 PTK7Q13308 1070 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 PRR16Q569H4 304 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 RETREG2Q8NC44 543 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 MBOAT7Q96N66 472 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 RIT2Q99578 217 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 DHX15O43143 795 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 MMP1P03956 469 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 CHMP4BP1P59074 171 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 ACTR2P61160 394 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 SP4Q02446 784 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 AFAP1L1Q8TED9 768 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 LENG9Q96B70 501 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 KIF3AQ9Y496 699 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 NRCAMQ92823 1304 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 JAK2O60674 1132 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 NEK8Q86SG6 692 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 GLG1Q92896 1179 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 IL23AQ9NPF7 189 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-203ENST00000474160 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 EDIL3O43854 480 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 CAND2O75155 1236 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 CYP2C9P11712 490 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 CYP2C18P33260 490 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 FAM160B1Q5W0V3 765 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 STAT5BP51692 787 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 INF2Q27J81 1249 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 KRT40Q6A162 431 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 GPR153Q6NV75 609 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 ABHD15Q6UXT9 468 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 SERINC5Q86VE9 423 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 TRIM50Q86XT4 487 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 RDM1Q8NG50 284 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 SLC5A5Q92911 643 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 ATP6V0A1Q93050 837 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 CTAGE1Q96RT6 745 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 RNPEPQ9H4A4 650 aa21.44■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 RRN3P2A6NIE6 340 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 TBX3O15119 743 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 MSH4O15457 936 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 CSF2RAP15509 400 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 SFNP31947 248 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 TNFRSF25Q93038 417 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 C8orf76Q96K31 380 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.43■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 WDR64B1ANS9 1081 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 GAS7O60861 476 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 CCNE2O96020 404 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 PSAPP07602 524 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 IQCF3P0C7M6 154 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 SELPP16109 830 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 JAK3P52333 1124 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 ADAM17P78536 824 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 LETM2Q2VYF4 491 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 RPAINQ86UA6 219 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 OXER1Q8TDS5 423 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 TMX3Q96JJ7 454 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 FAM20AQ96MK3 541 aa21.42■■□□□ 1.02
SYF2-203ENST00000474160 PCYT2Q99447 389 aa21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms