RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473460.1

GINS1-202, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene GINS1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-202ENST00000473460 SEC61A2Q9H9S3 476 aa5.55□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 KCND1Q9NSA2 647 aa5.55□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa5.55□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 ZBTB7CA1YPR0 619 aa5.54□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 IL18BPO95998 194 aa5.54□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 CHGBP05060 677 aa5.54□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 TUSC3Q13454 348 aa5.54□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 GPR155Q7Z3F1 870 aa5.54□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 KCTD13Q8WZ19 329 aa5.54□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 IER2Q9BTL4 223 aa5.54□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.54□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa5.54□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 ZFP69BQ9UJL9 534 aa5.54□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa5.54□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP5.53□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 CD276Q5ZPR3 534 aa5.53□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 EEPD1Q7L9B9 569 aa5.53□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 STPG3Q8N7X2 389 aa5.53□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 PHF20Q9BVI0 1012 aa5.53□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 KATNBL1Q9H079 304 aa5.53□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 EPN3Q9H201 632 aa5.53□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 CAPN10Q9HC96 672 aa5.53□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 PTPN22Q9Y2R2 807 aa5.53□□□□□ -1.52
GINS1-202ENST00000473460 COL6A2P12110 1019 aa5.52□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 GLRBP48167 497 aa5.52□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 PFKPQ01813 784 aa5.52□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 CRB2Q5IJ48 1285 aa5.52□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 KCNT2Q6UVM3 1135 aa5.52□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 USP53Q70EK8 1073 aa5.52□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 USP51Q70EK9 711 aa5.52□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 ZNF408Q9H9D4 720 aa5.52□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 ACOT7O00154 380 aa5.51□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 FGRP09769 529 aa5.51□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 GRK2P25098 689 aa5.51□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 GRK3P35626 688 aa5.51□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 NTRK3Q16288 839 aa5.51□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 LBX2Q6XYB7 198 aa5.51□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa5.51□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 LRRC37BQ96QE4 947 aa5.51□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 LMF1Q96S06 567 aa5.51□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa5.51□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 ZNF839A8K0R7 811 aa5.5□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 FBXO21O94952 628 aa5.5□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 EPHA5P54756 1037 aa5.5□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 MIIPQ5JXC2 388 aa5.5□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.5□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 REXO1L1PQ8IX06 675 aa5.5□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 ZNF503Q96F45 646 aa5.5□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 NPIPB8E9PQR5 432 aa5.49□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 AGRPO00253 132 aa5.49□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 FOXE3Q13461 319 aa5.49□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 KIZQ2M2Z5 673 aa5.49□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 KCTD1Q719H9 257 aa5.49□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 TAX1BP1Q86VP1 789 aa5.49□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 FUKQ8N0W3 1084 aa5.49□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 SH3RF2Q8TEC5 729 aa5.49□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 DCAF4Q8WV16 495 aa5.49□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 KCNJ15Q99712 375 aa5.49□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 H0Y858 1186 aa5.48□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 PLSCR1O15162 318 aa5.48□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 GNAT1P11488 350 aa5.48□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 USP10Q14694 798 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 RNF207Q6ZRF8 634 aa5.48□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 Q6ZSN1 163 aa5.48□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 VPS37DQ86XT2 251 aa5.48□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 IFNL2Q8IZJ0 200 aa5.48□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 OSBP2Q969R2 916 aa5.48□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 ADOQ96SZ5 270 aa5.48□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP5.48□□□□□ -1.535e-9■■■■□ 23.9
GINS1-202ENST00000473460 ARHGEF4Q9NR80 690 aa5.48□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 DSEQ9UL01 958 aa5.48□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa5.47□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 BLACEA4D250 179 aa5.47□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 SOD2P04179 222 aa5.47□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 SPIRE1Q08AE8 756 aa5.47□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 DUSP8Q13202 625 aa5.47□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 RNF151Q2KHN1 245 aa5.47□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 HS1BP3Q53T59 392 aa5.47□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 AGBL4Q5VU57 503 aa5.47□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 MCF2L2Q86YR7 1114 aa5.47□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 EDAQ92838 391 aa5.47□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 SGSM3Q96HU1 749 aa5.47□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa5.47□□□□□ -1.53
GINS1-202ENST00000473460 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
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