RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.61■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.61■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 ST3GAL1Q11201 340 aa22.61■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 RABEP1Q15276 862 aa22.61■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.61■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 RETREG2Q8NC44 543 aa22.61■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 CAGE1Q8TC20 777 aa22.61■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 TBCKQ8TEA7 893 aa22.61■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 IL23AQ9NPF7 189 aa22.61■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.61■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.6■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 EDIL3O43854 480 aa22.6■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 ACRP10323 421 aa22.6■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 ACTR2P61160 394 aa22.6■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 HIC1Q14526 733 aa22.6■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.6■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.6■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 GLG1Q92896 1179 aa22.6■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 SCLYQ96I15 445 aa22.6■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.6■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.6■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.6■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 HOXC8P31273 242 aa22.59■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 PTK7Q13308 1070 aa22.59■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM240Q5SV17 173 aa22.59■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 LENG9Q96B70 501 aa22.59■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 LRCH3Q96II8 777 aa22.59■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 UIMC1Q96RL1 719 aa22.59■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.59■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.59■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.59■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 EMSYQ7Z589 1322 aa22.58■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 LGR5O75473 907 aa22.58■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 IQCF3P0C7M6 154 aa22.58■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 GNAT1P11488 350 aa22.58■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF365Q70YC5 407 aa22.58■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.58■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.58■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.58■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 AZI2Q9H6S1 392 aa22.58■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 KAT6AQ92794 2004 aa22.58■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.57■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 ST18O60284 1047 aa22.57■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 CCNE2O96020 404 aa22.57■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 MARK3P27448 753 aa22.57■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 RFC2P35250 354 aa22.57■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 RBL2Q08999 1139 aa22.57■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 SERINC5Q86VE9 423 aa22.57■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 IL27Q8NEV9 243 aa22.57■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 PCYT2Q99447 389 aa22.57■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 SETD4Q9NVD3 440 aa22.57■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.56■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 ATG7O95352 703 aa22.56■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 FGBP02675 491 aa22.56■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 PFKMP08237 780 aa22.56■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 SELPP16109 830 aa22.56■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 CYP3A7P24462 503 aa22.56■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 INF2Q27J81 1249 aa22.56■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 OXER1Q8TDS5 423 aa22.56■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.56■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.56■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.56■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.56■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 NRCAMQ92823 1304 aa22.56■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 SCN5AQ14524 2016 aa22.55■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 MSH4O15457 936 aa22.55■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 TREHO43280 583 aa22.55■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 TDP2O95551 362 aa22.55■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 CKBP12277 381 aa22.55■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 KRT2P35908 639 aa22.55■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 STAT5BP51692 787 aa22.55■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM29Q14134 588 aa22.55■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 Q4G0T1 1027 aa22.55■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.55■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.55■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.55■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.55■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.55■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.55■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 WNT8BQ93098 351 aa22.55■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 VWCEQ96DN2 955 aa22.55■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.54■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 ADAM17P78536 824 aa22.54■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 KRT76Q01546 638 aa22.54■■□□□ 1.2
CTPS1-206ENST00000470271 PPFIA1Q13136 1202 aa22.54■■□□□ 1.2
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