RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	CD4	P01730	458 aa		20.14	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	MMP1	P03956	469 aa		20.14	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		20.14	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	20.14	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	NR5A1	Q13285	461 aa		20.14	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	20.14	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	20.14	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	LETM2	Q2VYF4	491 aa		20.14	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	TRIM50	Q86XT4	487 aa		20.14	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	BAD	Q92934	168 aa		20.14	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		20.14	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		20.14	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	20.14	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	20.14	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		20.13	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	TDP2	O95551	362 aa		20.13	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	CYP2C9	P11712	490 aa		20.13	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	20.13	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	GLG1	Q92896	1179 aa		20.13	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		20.13	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	TBX21	Q9UL17	535 aa		20.13	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	BTBD18	B2RXH4	712 aa		20.12	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	HAS3	O00219	553 aa		20.12	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	ACTR2	P61160	394 aa		20.12	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	PTGIS	Q16647	500 aa		20.12	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	NEK8	Q86SG6	692 aa		20.12	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	LRCH3	Q96II8	777 aa		20.12	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	HIPK3	Q9H422	1215 aa		20.12	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	AZI2	Q9H6S1	392 aa		20.12	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		20.12	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	EDIL3	O43854	480 aa		20.11	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	TIMP1	P01033	207 aa		20.11	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	ITGB8	P26012	769 aa		20.11	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	MARK3	P27448	753 aa		20.11	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	20.11	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	20.11	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	20.11	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		20.11	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	KIF3A	Q9Y496	699 aa		20.11	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	WDR81	Q562E7	1941 aa		20.1	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	FAM205C	A6NFA0	338 aa		20.1	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	BACH1	O14867	736 aa		20.1	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	MSH4	O15457	936 aa		20.1	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	20.1	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	CYP2C18	P33260	490 aa		20.1	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	20.1	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	GPR153	Q6NV75	609 aa		20.1	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	SESTD1	Q86VW0	696 aa		20.1	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	LENG9	Q96B70	501 aa		20.1	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		20.1	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	SAMM50	Q9Y512	469 aa		20.1	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		20.09	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	20.09	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	MARCH6	O60337	910 aa		20.09	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	GAS7	O60861	476 aa		20.09	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	CCNE2	O96020	404 aa		20.09	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		20.09	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		20.09	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	CYP3A7	P24462	503 aa		20.09	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	CCL23	P55773	120 aa		20.09	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902		Q4G0T1	1027 aa		20.09	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		20.09	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		20.09	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	GJA10	Q969M2	543 aa		20.09	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	20.09	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		20.09	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		20.09	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	20.09	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		20.08	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	20.08	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	KRT76	Q01546	638 aa		20.08	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	FPGS	Q05932	587 aa		20.08	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	MFSD5	Q6N075	450 aa		20.08	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		20.08	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	TMEM199	Q8N511	208 aa		20.08	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		20.08	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	TNFRSF25	Q93038	417 aa		20.08	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	20.08	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		20.08	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		20.08	■□□□□ 0.81
USP19-210	ENST00000465902	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		20.07	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	CHMP2A	O43633	222 aa		20.07	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	20.07	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	ATP2B1	P20020	1258 aa		20.07	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	GJB2	P29033	226 aa		20.07	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	STAT5B	P51692	787 aa		20.07	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		20.07	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	20.07	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	RETREG2	Q8NC44	543 aa		20.07	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	SLC5A5	Q92911	643 aa		20.07	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		20.07	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	RIT2	Q99578	217 aa		20.07	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	SETD4	Q9NVD3	440 aa		20.07	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	EMSY	Q7Z589	1322 aa		20.06	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	SLC37A4	O43826	429 aa		20.06	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	LGR5	O75473	907 aa		20.06	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	GNAT1	P11488	350 aa		20.06	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	BFSP2	Q13515	415 aa		20.06	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		20.06	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		20.06	■□□□□ 0.8

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