RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP4-208ENST00000464168 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
USP4-208ENST00000464168 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
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USP4-208ENST00000464168 DOCK5Q9H7D0 1870 aa26.03■■□□□ 1.76
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USP4-208ENST00000464168 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
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USP4-208ENST00000464168 TIGD5Q53EQ6 642 aa26■■□□□ 1.75
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USP4-208ENST00000464168 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
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USP4-208ENST00000464168 COL19A1Q14993 1142 aa25.97■■□□□ 1.75
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USP4-208ENST00000464168 CALM3P0DP25 149 aa25.96■■□□□ 1.75
USP4-208ENST00000464168 LIFRP42702 1097 aa25.96■■□□□ 1.75
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USP4-208ENST00000464168 RSPH3Q86UC2 560 aa25.96■■□□□ 1.75
USP4-208ENST00000464168 DNAJB3Q8WWF6 145 aa25.96■■□□□ 1.75
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USP4-208ENST00000464168 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
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USP4-208ENST00000464168 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.95■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 CCDC82Q8N4S0 544 aa25.95■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 JADE2Q9NQC1 790 aa25.95■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 PCDHA6Q9UN73 950 aa25.95■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa25.95■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.95■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 KAT6AQ92794 2004 aa25.94■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 SLC27A2O14975 620 aa25.94■■□□□ 1.74
USP4-208ENST00000464168 RB1P06400 928 aa25.94■■□□□ 1.74
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