RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 TXLNGQ9NUQ3 528 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 CPP00450 1065 aa11.9□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 GUCY2CP25092 1073 aa11.9□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SLCO1A2P46721 670 aa11.9□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CUL4AQ13619 759 aa11.9□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PRPSAP1Q14558 356 aa11.9□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT80Q6KB66 452 aa11.9□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 TTLL7Q6ZT98 887 aa11.9□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PCGF5Q86SE9 256 aa11.9□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAAF3Q8N9W5 541 aa11.9□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 MORC4Q8TE76 937 aa11.9□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 XPOTO43592 962 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 COBLO75128 1261 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 FTCDO95954 541 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 MYL1P05976 194 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 GAP43P17677 238 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC7A3Q8WY07 619 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP6V0A1Q93050 837 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PBKQ96KB5 322 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 TLK1Q9UKI8 766 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 GNGT2O14610 69 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 MCF2LO15068 1137 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ACTN1P12814 892 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 NR1D1P20393 614 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CA4P22748 312 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PHKA1P46020 1223 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SNX1Q13596 522 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CASP8Q14790 479 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 TMED2Q15363 201 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 DCAF15Q66K64 600 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ACRBPQ8NEB7 543 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 TUBB6Q9BUF5 446 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 OSBPL3Q9H4L5 887 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CARMIL3Q8ND23 1372 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA8SH3BPF8 625 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP2B4P23634 1241 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CCNE1P24864 410 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CASP2P42575 452 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 IQCB1Q15051 598 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 TAF11Q15544 211 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CCNYQ8ND76 341 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC17A8Q8NDX2 589 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM81BQ96LP2 452 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 FMO2Q99518 471 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNQ3O43525 872 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 NDUFA10O95299 355 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CLCN6P51797 869 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC41Q15345 812 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ALS2CLQ60I27 953 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCC12Q96J65 1359 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SRGAP2BP0DMP2 458 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 BTDP43251 543 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 BASP1P80723 227 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP27A1Q02318 531 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR11Q9BZH6 1224 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 TBK1Q9UHD2 729 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CCPG1Q9ULG6 757 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 TRPA1O75762 1119 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CALN1Q9BXU9 219 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ORC6Q9Y5N6 252 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 C1orf167Q5SNV9 1468 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A087WWV3 80 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 TLR3O15455 904 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 RFX1P22670 979 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 EMBQ6PCB8 327 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PDIK1LQ8N165 341 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 RASGRP4Q8TDF6 673 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CHMP6Q96FZ7 201 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 S100BP04271 92 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 IFNAR1P17181 557 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ASPRV1Q53RT3 343 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SESTD1Q86VW0 696 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM133AQ8N9E0 248 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CCHCR1Q8TD31 782 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 MID2Q9UJV3 735 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms