RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 JAK2O60674 1132 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ACRP10323 421 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ACTR2P61160 394 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ST3GAL1Q11201 340 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 BFSP2Q13515 415 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 RABEP1Q15276 862 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 SCLYQ96I15 445 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF577Q9BSK1 485 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 IL23AQ9NPF7 189 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 DHX15O43143 795 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 SETQ01105 290 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM240Q5SV17 173 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 GLG1Q92896 1179 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.434e-6■■■□□ 14.7
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PITPNM1O00562 1244 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ATG7O95352 703 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 IQCF3P0C7M6 154 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PTK7Q13308 1070 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF365Q70YC5 407 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 CAGE1Q8TC20 777 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 LRCH3Q96II8 777 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PCYT2Q99447 389 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D22BQ9NU19 505 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 SETD4Q9NVD3 440 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 LGR5O75473 907 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 GNAT1P11488 350 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 OXER1Q8TDS5 423 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 LENG9Q96B70 501 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 AZI2Q9H6S1 392 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 LTBP2Q14767 1821 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 CCNE2O96020 404 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 FGBP02675 491 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP3A7P24462 503 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 MARK3P27448 753 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 HOXC8P31273 242 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 INF2Q27J81 1249 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 MSH4O15457 936 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 TREHO43280 583 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ST18O60284 1047 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 CKBP12277 381 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 STAT5BP51692 787 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 Q4G0T1 1027 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ABHD15Q6UXT9 468 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 IL27Q8NEV9 243 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 VWCEQ96DN2 955 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 NRCAMQ92823 1304 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 SELPP16109 830 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 RFC2P35250 354 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT2P35908 639 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 RBL2Q08999 1139 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 SERINC5Q86VE9 423 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 WNT8BQ93098 351 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 EMSYQ7Z589 1322 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 TDP2O95551 362 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 FOSBP53539 338 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAM17P78536 824 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM29Q14134 588 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 MOXD1Q6UVY6 613 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 BACH2Q9BYV9 841 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 BACH1O14867 736 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 PPFIA1Q13136 1202 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 NR5A1Q13285 461 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 LETM2Q2VYF4 491 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT40Q6A162 431 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 SWSAP1Q6NVH7 229 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC8DQ7L1W4 858 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 OTOP2Q7RTS6 562 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-204ENST00000416021 HERVK_113Q902F9 699 aa23.9■■□□□ 1.42
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