RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 PITPNM1O00562 1244 aa30.94■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 PPFIA4O75335 1185 aa30.94■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 ITGB5P18084 799 aa30.94■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGAP4P98171 946 aa30.94■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 GNPTABQ3T906 1256 aa30.94■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 RETREG2Q8NC44 543 aa30.94■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 GBF1Q92538 1859 aa30.94■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 CDH23Q9H251 3354 aa30.94■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 DOCK5Q9H7D0 1870 aa30.93■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa30.93■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 C7orf31Q8N865 590 aa30.93■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 MLXIPQ9HAP2 919 aa30.93■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 FOSBP53539 338 aa30.92■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 BFSP2Q13515 415 aa30.92■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 HIC1Q14526 733 aa30.92■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 NLRX1Q86UT6 975 aa30.92■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 C16orf70Q9BSU1 422 aa30.92■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 KATNAL1Q9BW62 490 aa30.92■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 TELO2Q9Y4R8 837 aa30.92■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 ZBBXA8MT70 800 aa30.91■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 FIBPO43427 364 aa30.91■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 CYP3A4P08684 503 aa30.91■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 CYP2W1Q8TAV3 490 aa30.91■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 OXER1Q8TDS5 423 aa30.91■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 GPRASP2Q96D09 838 aa30.91■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 MXRA8Q9BRK3 442 aa30.91■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 JADE2Q9NQC1 790 aa30.91■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa30.91■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 EDIL3O43854 480 aa30.9■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 PFKMP08237 780 aa30.9■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 RABGGTBP53611 331 aa30.9■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 KRT40Q6A162 431 aa30.9■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 CYFIP1Q7L576 1253 aa30.9■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 TET1Q8NFU7 2136 aa30.89■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 FOSL2P15408 326 aa30.89■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 RFC2P35250 354 aa30.89■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 GPNMBQ14956 572 aa30.89■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 WNT8BQ93098 351 aa30.89■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa30.89■■■□□ 2.54
GNPTAB-202ENST00000392919 MMP1P03956 469 aa30.88■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 CUL4AQ13619 759 aa30.88■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 CEP55Q53EZ4 464 aa30.88■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM184AQ8NB25 1140 aa30.88■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 CAGE1Q8TC20 777 aa30.88■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 MSRAQ9UJ68 235 aa30.88■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 MEIS1O00470 390 aa30.87■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 LGALS2P05162 132 aa30.87■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 MYOGP15173 224 aa30.87■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 MTMR1Q13613 665 aa30.87■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 TRIM29Q14134 588 aa30.87■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 RAB30Q15771 203 aa30.87■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 TBCKQ8TEA7 893 aa30.87■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 AFAP1L1Q8TED9 768 aa30.87■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 CDHR1Q96JP9 859 aa30.87■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP30.87■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM86B1E9PN63 330 aa30.86■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 ATP9AO75110 1047 aa30.86■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM86B2P0C5J1 330 aa30.86■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 CIITAP33076 1130 aa30.86■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 KRT2P35908 639 aa30.86■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF76P36508 570 aa30.86■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 GUCY1B3Q02153 619 aa30.86■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 NEDD9Q14511 834 aa30.86■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 METTL7BQ6UX53 244 aa30.86■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 KRT25Q7Z3Z0 450 aa30.86■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC155Q8N6L0 562 aa30.86■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 TNFRSF25Q93038 417 aa30.86■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 SNX21Q969T3 373 aa30.86■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 C8orf76Q96K31 380 aa30.86■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 SENP7Q9BQF6 1050 aa30.86■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 H3BRB1 525 aa30.85■■■□□ 2.53
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GNPTAB-202ENST00000392919 MAFGO15525 162 aa30.85■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 ARP10275 920 aa30.85■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 CKBP12277 381 aa30.85■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 SELPP16109 830 aa30.85■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 KCNA2P16389 499 aa30.85■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 RBL2Q08999 1139 aa30.85■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 NR5A1Q13285 461 aa30.85■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 LRRC8DQ7L1W4 858 aa30.85■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 NIPA1Q7RTP0 329 aa30.85■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 GPR20Q99678 358 aa30.85■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 KCNH7Q9NS40 1196 aa30.85■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa30.84■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 USP11P51784 963 aa30.84■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 SP4Q02446 784 aa30.84■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 PTK7Q13308 1070 aa30.84■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP30.84■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
GNPTAB-202ENST00000392919 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
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