RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa16.98■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 ACRP10323 421 aa16.98■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 RABEP1Q15276 862 aa16.98■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 PRR16Q569H4 304 aa16.98■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 GALNT17Q6IS24 598 aa16.98■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 C16orf59Q7L2K0 433 aa16.98■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 WNT8BQ93098 351 aa16.98■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 PCYT2Q99447 389 aa16.98■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 SDF4Q9BRK5 362 aa16.98■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 NOD1Q9Y239 953 aa16.98■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 DHX15O43143 795 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 CCNE2O96020 404 aa16.97■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 MARK3P27448 753 aa16.97■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 HOXC8P31273 242 aa16.97■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 ACTR2P61160 394 aa16.97■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 SETQ01105 290 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.97■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM199Q8N511 208 aa16.97■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 VWCEQ96DN2 955 aa16.97■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 LRCH3Q96II8 777 aa16.97■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.97■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 TANC1Q9C0D5 1861 aa16.97■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 C17orf102A2RUQ5 167 aa16.96■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 TDP2O95551 362 aa16.96■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 XBP1P17861 261 aa16.96■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 INF2Q27J81 1249 aa16.96■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 LRIT3Q3SXY7 679 aa16.96■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM240Q5SV17 173 aa16.96■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 KRT25Q7Z3Z0 450 aa16.96■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 WASF1Q92558 559 aa16.96■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF577Q9BSK1 485 aa16.96■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 RNPEPQ9H4A4 650 aa16.96■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 EMSYQ7Z589 1322 aa16.96■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 FAM205CA6NFA0 338 aa16.95■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 MSH4O15457 936 aa16.95■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 LGR5O75473 907 aa16.95■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 USP11P51784 963 aa16.95■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 NR5A1Q13285 461 aa16.95■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 GJA10Q969M2 543 aa16.95■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 IL23AQ9NPF7 189 aa16.95■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 SETD4Q9NVD3 440 aa16.95■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 SCN5AQ14524 2016 aa16.95■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 PITPNM1O00562 1244 aa16.94■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 TREHO43280 583 aa16.94■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 ATG7O95352 703 aa16.94■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 IQCF3P0C7M6 154 aa16.94■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 RBL2Q08999 1139 aa16.94■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 PTK7Q13308 1070 aa16.94■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 BFSP2Q13515 415 aa16.94■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 KRT40Q6A162 431 aa16.94■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa16.94■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF365Q70YC5 407 aa16.94■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 CAGE1Q8TC20 777 aa16.94■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 GLG1Q92896 1179 aa16.94■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 TNFRSF25Q93038 417 aa16.94■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 ATP6V0A1Q93050 837 aa16.94■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 BACH2Q9BYV9 841 aa16.94■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 SZT2Q5T011 3432 aa16.94■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa16.93■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 KRT2P35908 639 aa16.93■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 ADAM17P78536 824 aa16.93■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 Q4G0T1 1027 aa16.93■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 ABHD15Q6UXT9 468 aa16.93■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 DEFB128Q7Z7B8 93 aa16.93■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 LMBR1Q8WVP7 490 aa16.93■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 MBOAT7Q96N66 472 aa16.93■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa16.93■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 ERAP1Q9NZ08 941 aa16.93■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa16.92■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa16.92■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 SLC37A4O43826 429 aa16.92■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 ST18O60284 1047 aa16.92■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 MMP1P03956 469 aa16.92■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 CKBP12277 381 aa16.92■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 CYP3A7P24462 503 aa16.92■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 GUCY1B3Q02153 619 aa16.92■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 GPNMBQ14956 572 aa16.92■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 LETM2Q2VYF4 491 aa16.92■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 TRAF7Q6Q0C0 670 aa16.92■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 MOXD1Q6UVY6 613 aa16.92■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 SERINC5Q86VE9 423 aa16.92■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC155Q8N6L0 562 aa16.92■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 RETREG2Q8NC44 543 aa16.92■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 AZI2Q9H6S1 392 aa16.92■□□□□ 0.3
CSAG1-201ENST00000361211 TBC1D22BQ9NU19 505 aa16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms